使用带有RStudio / rmarkdown / knitr的包texreg创建模型汇总表

Question

我正在使用带有rmarkdown的RStudio IDE（v 0.99.323）并尝试使用knitr通过htmlreg生成模型表以生成MSWord输出。怀疑我错过了一些简单的事情。

下面附加的rmarkdown块创建了一个单独的单词文件'mytable.doc'，带有漂亮的表格。但是，当我在RStudio IDE中单击“Knit Word”时，行htmlreg（m）会在MSWord文档中生成html表代码。我做错了什么？

非常感谢！ --Dale

```{r, results='asis'}
library(MASS)
library(texreg)
data(menarche)
m <- glm(cbind(Menarche, Total-Menarche) ~ Age, family=binomial(logit), data=menarche)

htmlreg(m, file = "mytable.doc", caption="Age at Menarche", inline.css = TRUE, doctype = TRUE, html.tag = TRUE,                                               head.tag = TRUE, body.tag = TRUE, ci.force=TRUE, ci.test=NULL,bold=TRUE)

htmlreg(m)
```

Answer 1

在你的块中尝试这个，仍然使用result='asis'：

library(pander)
pander(m)

帽子提示http://www.r-statistics.com/2013/03/write-ms-word-document-using-r-with-as-little-overhead-as-possible/

他们还提出了一种澄清代码块的好方法，这样您就可以调用print(m)，并且markdown中的输出将从pander调用相应的函数。

Answer 2

您能否请尝试最新的texreg版本1.34.2（请参阅.tar.gz文件here或this帖子）？

根据RStudio开发人员的说法，问题是他们切换到了更新版本的Pandoc，它不再适用于缩进的HTML代码。更确切地说，它将用四个空格缩进的文本解释为代码块，如Markdown表示法。有关问题说明，请参阅here。

因此，在新的texreg版本中，indentation = ""函数中有一个名为htmlreg的新参数。它默认关闭缩进。使用indentation = " "恢复以前的行为。

修改1 ：另请确保在左侧使用参数center = FALSE和star.symbol = "\\*"进行对齐，并正确显示有效星。星号需要被转义，因为它们被解释为Markdown语法的一部分：

```{r, results = 'asis'}
htmlreg(m, center = FALSE, star.symbol = "\\*")
```{r}

对于PDF笔记本（内部使用LaTeX），请使用texreg：

```{r, results = 'asis'}
texreg(m, float.pos = "h")
```{r}

编辑2 ：另请阅读htmlreg的帮助页面，尤其是描述htmlreg参数的部分。它们包含一些有用的信息，介绍如何使文档与Markdown尽可能兼容，Markdown由RStudio，Pandoc和knitr用于创建HTML文档。特别是，当您不打算创建完整的HTML文档时，请使用参数inline.css = TRUE，doctype = FALSE，html.tag = FALSE，head.tag = FALSE和body.tag = FALSE。< / p>

关于 MS Word ：您在问题下方的评论中提到您要创建HTML或Word文档。 htmlreg函数用于创建HTML文件，而不是Word文件（如函数名称所示）。但是，可以在MS Word中加载这些HTML文件，因为Word能够解释HTML代码。但是，据我所知，knitr创建了二进制Word文档，并且直接在这些二进制Word文档中嵌入HTML代码是不可能的（但我可能错了，因为我不知道knitr如何在内部创建Word文件）。但是，您可以尝试创建HTML笔记本，将它们保存到磁盘，然后在MS Word中打开它们。

Answer 3

这是pandoc降价或htmlreg无法创建正确缩进的问题。由于含糊不清，我不完全理解这是一个错误还是一个功能：

http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_pandoc_markdown.html#raw-html

尝试使用简单的.md（非.rmd）文件，如下所示：

<h1>Works</h1>

<table border="8">
  <tr>
  <td>111</td>
  <td>222</td>
  <td>444</td>
  </tr>
</table>

<h1>Not what you want</h1>

<table border="8">
  <tr>
    <td>111</td>
    <td>222</td>
    <td>444</td>
  </tr>
</table>

<h1>Works too (not in screenshot)</h1>

<table border="8">
  <tr><td>111</td><td>222</td><td>444</td></tr>
</table>

Answer 4

默认情况下，软件包作者已更新texreg以关闭缩进。

请参阅： http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_migrating_from_v1.html#preserving-generated-html 通过以下方式更新包后： install.packages（＆＃34; texreg＆＃34;，repos =＆＃34; http://R-Forge.R-project.org＆＃34;）

下面放在rmarkdown（.Rmd）文档中的块现在可以在我编织HTML＆＃39;在RStudio内。然而，＆＃39; Knit Word＆＃39;仍然没有产生预期的产出。

```{r，results =＆＃39; asis＆＃39;}

库（texreg）

htmlreg（m，caption =＆＃34; Age at Menarche＆＃34;，caption.above = TRUE，ci.force = TRUE，ci.test = NULL，bold = TRUE）

```