使用sed命令替换Fastq文件头中的模式

Question

我有一个fastq文件，我需要根据三位一体的需要编辑它的标题。我的标题是这样的：

1. @ SRR1561197。 1 .1 HWI-ST1379：100：C29NPACXX：7：1101： 2115：2122 length = 102
2. @ SRR1561197。 2 .1 HWI-ST1379：100：C29NPACXX：7：1101： 2202：2120 length = 102
3. @ SRR1561197。 3 .1 HWI-ST1379：100：C29NPACXX：7：1101： 2319：2125 length = 102
4. @ SRR1561197。 4 .1 HWI-ST1379：100：C29NPACXX：7：1101： 2510：2121 length = 102

在上面的标题中，粗体文字会随着每个标题不断变化，其他文字保持不变。 现在我想要一次性替换所有标题，并使用导致以下标题的模式：

@MexD1SRR1561197.1/1
@MexD1SRR1561197.2/1 
@MexD1SRR1561197.3/1
@MexD1SRR1561197.4/1

我使用了以下命令，但它没有改变任何东西：

sed 's/ HWI.*/\/1/g' SRR1561197_1.fastq > change.fastq

sed 's/ HWI.+/\/1/g' SRR1561197_1.fastq > change.fastq

请帮助任何人？

Answer 1

我怀疑这就是你想要的：

sed 's|^@|@MexD1|;  s| HWI.*|/1|g' SRR1561197_1.fastq > change.fastq

请注意，HWT已更改为HWI。