使用R在ESRI Shapefile中读取时出错

时间:2015-03-10 05:54:16

标签: r gdal rgdal

我试图使用rgdal库读取shapefile,但没有运气。

当我尝试使用以下语法导入时:

geo <- readOGR("/path/to/layer","layer")

我遇到了错误

Error in stopifnot(is.list(srl)) : infinite label point

如何进行诊断和解决问题?非常感谢。

1 个答案:

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TL; DR:可能是自相交或重叠的几何图形,多边形Shapefile中的环/孔存在问题。

首先,通过在提示符中输入不带参数的函数名来查看readOGR的源代码。源上的“查找”表示错误中的代码和消息不在该函数中。

使用this approach,我找到了readOGR调用的函数列表:

 [1] "-"                        ":"                        "!"                        "!="                       ".Call"                   
 [6] "("                        "["                        "[["                       "{"                        "&&"                      
[11] "%in%"                     "+"                        "<"                        "<-"                       "<="                      
[16] "=="                       ">"                        "||"                       "$"                        "all.equal"               
[21] "any"                      "as.character"             "as.integer"               "as.logical"               "attr"                    
[26] "attributes"               "c"                        "cat"                      "cbind"                    "class"                   
[31] "comment"                  "CRS"                      "data.frame"               "do.call"                  "for"                     
[36] "function"                 "gc"                       "geometry"                 "getCPLConfigOption"       "getGDALVersionInfo"      
[41] "iconv"                    "identical"                "if"                       "ifelse"                   "integer"                 
[46] "is.character"             "is.na"                    "is.null"                  "isTRUE"                   "lapply"                  
[51] "length"                   "Line"                     "Lines"                    "list"                     "make.names"              
[56] "match"                    "match.arg"                "max"                      "message"                  "missing"                 
[61] "names"                    "nchar"                    "nrow"                     "ogrFIDs"                  "ogrInfo"                 
[66] "paste"                    "Polygon"                  "Polygons"                 "print"                    "rbind"                   
[71] "return"                   "rm"                       "sapply"                   "seq"                      "seq_along"               
[76] "setCPLConfigOption"       "slot"                     "sort"                     "SpatialLines"             "SpatialLinesDataFrame"   
[81] "SpatialPointsDataFrame"   "SpatialPolygons"          "SpatialPolygonsDataFrame" "stop"                     "stopifnot"               
[86] "strsplit"                 "sum"                      "suppressMessages"         "switch"                   "table"                   
[91] "try"                      "unique"                   "vector"                   "warning"                  "which" 

其中列出的函数实际上是library(sp)的一部分(您可以告诉他们,因为他们在打印源时说<environment: namespace:sp>),并且错误消息看起来像comes from PolygonPolygons个类。

Polygons中,我们从错误消息中找到代码位:stopifnot(is.list(srl))。查看help(Polygons),您会看到srl是“Polygon类对象列表”,因此错误意味着正在传递除列表之外的其他内容。

现在,我们应该回到readOGR的来源,并寻找对Polygons的调用(有三个)。两个第一个调用make_Polygonlist(一个C rgdal函数),第三个调用它自己的列表pllist。最后一个是有趣的,因为错误是沉默的:try(pllist[[j]] <- Polygon(cmat), silent = TRUE),这意味着这不太可能引发你的错误。这留下了另外两个,并将您带到this source code,我们看到makePolygonlist在同一个脚本中调用make_Polygon

在那里阅读(这不是我的主要语言),我看到有关的评论:

  

//基于默认评论的洞设置(OGC SFS订单)   //但是如果注释为NULL 121019

则按顺序排列

稍后:

SET_STRING_ELT(VECTOR_ELT(dimnames, 1), 0, COPY_TO_USER_STRING("x"));
SET_STRING_ELT(VECTOR_ELT(dimnames, 1), 1, COPY_TO_USER_STRING("y"));

这表明它需要某种x,y坐标才能处理多边形中的孔/环。返回help("Polygons-class"),我们看到参数labpt,即:

  

类“数字”的对象;一对x,y坐标给出一个标签   point,最大环组件的标签点

现在我们可以给出一个关于错误原因的假设:它与多边形中环/孔的处理有关,并且在创建Polygon对象时,它需要标签点来正确处理环/孔。但是,它找到的标签点不是有限的,并且会触发错误。

最后,有一个注释:

  

属于多边形对象的多边形对象应该不是   相互重叠,或应完全包括(作为湖泊或岛屿   湖泊)。它们不应该是自相交的。

这表明你可能遇到了一个重叠或自相交的坏几何问题。您可以使用工具(例如在QGis中)来检查和修复几何体。