Question

我想知道seqici（）是否依赖于上下文？我有一个序列，我计算复杂性seqici（mySeq）。我在一组序列中有相同的序列，我计算复杂性并具有不同的值。有人可以帮助知道会发生什么吗？

谢谢，

Answer 1

我想我得到了。是的，复杂性取决于＆＃34; context＆＃34;。当你把所有序列放在一起时，seqici（）使用＆＃34; common＆＃34;字母表来计算复杂性。因此，如果序列中没有字母表的元素，则该序列的复杂性将在单独计算与在序列集中计算时发生变化。如图所示，

d1 <- data.frame(s1 = c("A", "B", "A", "C", "B", "A"))
d2 <- data.frame(s2= c("A", "C", "B", "B", "D"))
d1 <- zoo(d1)
d2 <- zoo(d2)
nm <- list("d1", "d2")

d <- zoo()
for(i in 1:length(nm)) 
  d <- merge(d, get(nm[[i]]))

d <- t(d)
seq <- seqdef(d)
seqici(seq)

//s1 0.8541510
//s2 0.8489541

d1 <- t(d1)
d2 <- t(d2)
seq1 <- seqdef(d1)
seq2 <- seqdef(d2)
seqici(seq1)
//s1 0.9594894
seqici(seq2)
//s2 0.8489541

结果的差异是因为＆＃34; D＆＃34;在d2而不在d1。

希望这可以帮助他人： - ）

Answer 2

Gabadinho的复杂性指数取决于序列的整体可能状态（字母表）。根据定义。这是一个基于你自己的例子：

myseq <- t(data.frame(s1 = c("A", "B", "A", "C", "B", "A")))

seq1a <- seqdef(myseq, alphabet = c("A","B","C"))
seqici(seq1a) # 0.9594894

seq1b <- seqdef(myseq, alphabet = c("A","B","C","D"))
seqici(seq1b) # 0.854151

如果在创建序列数据时未指定字母，TraMineR将使用数据中存在的不同状态进行设置。因此，根据您的输入数据，字母表可能会有所不同，然后您可能会根据字母表获得不同的测量结果。

为避免混淆，始终明确定义嵌入序列的字母表是一个很好的规则。

TraMineR：seqici为相同的序列提供不同的结果

2 个答案: