当没有这样的命名列时,SQLite会给出找不到列的错误

时间:2015-03-06 22:22:50

标签: python database sqlite pandas sqlalchemy

我正在使用sqlite数据库在Pandas和Sqlalchemy的帮助下开发解析器。我正在读取文件并将值分配到列中。

dataFrame = pd.read_fwf('gf1401.gam',colspecs=colspaces,skiprows=37,nrows=1764)
dataFrame.columns=['elem','index','E','J','label','glande']
dataFrame['glande']=dataFrame['glande'].map(lambda x: '%1.3f' % x)
print dataFrame.head()
engine = create_engine('sqlite:///dab.sqlite')
conn = engine.raw_connection()
dataFrame.to_sql(name='parser', con=conn, if_exists='append')

现在最后一行给出了一个奇怪的错误 sqlite3.OperationalError: table parser has no column named level_0

这就是我使用sqlalchemy

创建数据库的方法
import sqlalchemy
from sqlalchemy import create_engine
engine = create_engine('sqlite:///dab.sqlite', echo=True)
from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base
Base = declarative_base()
from sqlalchemy import Column, Integer, String, Numeric, Float
class parser(Base):
    __tablename__ = 'parser'

    id = Column(Integer, primary_key=True)
    elem = Column(String)
    index = Column(Integer)
    E = Column(Numeric)
    J = Column(Float)
    label = Column(String)
    glande = Column(Numeric)


parser.__table__
Base.metadata.create_all(engine)

from sqlalchemy.orm import sessionmaker
Session = sessionmaker(bind=engine)

正如您所看到的,我甚至没有名为0级的列。 请帮忙。 我没有在pandas中使用id列,因为sqlite会自动插入主键的值。 我想要的只是将数据框中的数据插入到sqlite数据库并添加一个可以充当主键的列

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

问题在于您已有的索引列。 Pandas尝试将数据帧的索引作为列'索引'插入,但由于已经有一个名为'index'的列,它使用下一个选项,即'level_0'。但是当您附加到表格时,此列不存在。可能这是熊猫中的一个错误,但现在有一些解决方法。

现在可能的解决方法是:

  • 指定不插入数据框的索引:dataFrame.to_sql(...., index=False)
  • 指定应插入索引的列名(如果需要):dataFrame.to_sql(...., index_label='id')
  • 或者你可以让to_sql创建数据库表本身(不附加),然后不需要python中的表定义。