Question

当笔记本电脑的输出非常长并且保存到笔记本电脑中时，我遇到了问题，只要我想再次打开这个特定的笔记本电脑，浏览器就会崩溃，无法正确显示。

要解决此问题，我必须使用文本编辑器打开它并删除该单元格的所有输出，从而导致问题。

我想知道是否有办法清理笔记本中的所有输出，这样可以再次打开它而不会出现问题。我想删除所有输出，因为删除一个特定的输出似乎更麻烦。

Answer 1

<强> --ClearOutputPreprocessor.enabled=True

现在有一个内置的命令行选项：

jupyter nbconvert --ClearOutputPreprocessor.enabled=True --inplace Notebook.ipynb

或另一个名为NotebookNoOut.ipynb的文件：

jupyter nbconvert --ClearOutputPreprocessor.enabled=True \
  --to notebook --output=NotebookNoOut Notebook.ipynb

jupyter nbconvert --help还会记录--clear-output选项，但由于某种原因它无效。

在Jupyter 4.4.0中测试过，笔记本== 5.7.6。

Answer 2

使用clean_ipynb，不仅可以清除笔记本的输出，还可以清除代码。

通过pip install clean_ipynb安装

由clean_ipynb hello.ipynb运行

Answer 3

如果您创建.gitattributes file，则可以在将某些文件添加到git之前对其进行过滤。这会将原始文件保留在磁盘上，但会提交“已清理”版本。

要使其正常工作，请将其添加到本地.git/config或全局~/.gitconfig：

[filter "strip-notebook-output"]
    clean = "jupyter nbconvert --ClearOutputPreprocessor.enabled=True --to=notebook --stdin --stdout --log-level=ERROR"

然后在带有笔记本的目录中创建一个.gitattributes文件，内容：

*.ipynb filter=strip-notebook-output

这是如何工作的：

该属性告诉git在将其添加到索引（暂存）之前，对每个笔记本文件运行过滤器的clean操作。
过滤器是我们的朋友nbconvert，设置为从stdin读取，写入stdout，剥离输出以及仅在有重要要说的地方发言。
从索引中提取文件时，将运行过滤器的smudge操作，但这是空操作，因为我们没有指定它。您可以在此处运行笔记本以重新创建输出（nbconvert --execute）。
请注意，如果过滤器因某种原因失败，则文件将暂存为未转换状态。

我对这个过程的唯一小抱怨是我可以提交.gitattributes，但是我必须告诉我的同事更新他们的.git/config。

如果您想要一个骇客但快得多的版本，请尝试JQ：

  clean = "jq '.cells[].outputs = [] | .cells[].execution_count = null | .'"

Answer 4

要扩展@dirkjot的答案以解决有关共享配置的问题：

创建本地.gitconfig文件，而不是修改.git / config。这使得需要在其他计算机上运行的命令稍微简单一些。您还可以创建脚本来运行git config命令：

git config --local include.path ../。gitconfig

请注意，我也已将日志级别更改为INFO，因为我确实想查看确认清理正在运行。

repo / .gitconfig

[filter "strip-notebook-output"]
    clean = "jupyter nbconvert --ClearOutputPreprocessor.enabled=True --to=notebook --stdin --stdout --log-level=INFO"

回购/.git属性

*.ipynb filter=strip-notebook-output

repo / git_configure.sh

git config --local include.path ../.gitconfig

然后，用户只需要运行：

$ chmod u+x git_configure.sh
$ ./git_configure.sh

Answer 5

我必须说，对于清除一些子数组和重置一些执行编号的简单工作，我发现 jupyer nbconvert 非常缓慢。这是一个在可维护性方面的卓越解决方案，因为如果 notebook 源代码格式发生变化，该工具有望得到更新。但是，如果您没有 nbconvert 6.0（我目前有一个运行 5.6.1 的环境……）

一个非常简单的 jq (a sort of sed for json) 脚本可以非常快速地完成这个技巧：

jq 'reduce path(.cells[]|select(.cell_type == "code")) as $cell (.; setpath($cell + ["outputs"]; []) | setpath($cell + ["execution_count"]; null))' notebook.ipynb

很简单，它识别代码单元，并分别用 outputs 和 execution_count 替换它们的 [] 和 null 属性。

<子>

或者如果您只想删除输出并保留执行编号，您可以做的更简单：

jq 'del(.cells[]|select(.cell_type == "code").outputs[])' notebook.ipynb

Answer 6

使用 - ClearOutputPreprocessor.enabled = True 和 - clear-output

遵循以下命令：

jupyter nbconvert --ClearOutputPreprocessor.enabled=True --clear-output *.ipynb

如何在Linux终端的所有单元格中清除IPython Notebook的输出？

6 个答案: