在bash脚本中将两个扩展文件用于循环的最佳方法是什么？

Question

你怎么能一次处理两个不同扩展名的文件。更重要的是，file.fa之类的文件与file.qv有关，需要同时处理。

问题：假设您不知道文件名（basename）和文件数（可能少于几百个），我们知道这两个文件的文件扩展名。

我尝试过：

for i in `ls -1 -v $input_reads_dir/reads/*.csfasta $input_reads_dir/reads/*.qual` ;do
    job -o /out{i} {i}.fa {i}.qv
done

问题：

1. 它不起作用
2. 我担心file1.csfasta file2.qual可能误导{{1}}这是不正确的，或者我不应该害怕。

Answer 1

检查相应的文件是否存在。

for f in *.csfasta
do
  if [ -f "${f%.csfasta}.qual" ]
  then
    dosomething "$f" "${f%.csfasta}.qual"
  fi
done