我喜欢使用 knitr
生成动态报告,并使用GitHub与我的同事分享。我通常做的是编织我的Rmarkdown脚本 - knit ('myfile.Rmd')
- 并生成一个可以在GitHub上直接看到的降价(myfile.md
)版本。 GitHub上的markdown文件对我来说比knitr使用pandoc生成的HTML文件好得多。
除非我想要显示表格,否则此工作流程通常无瑕疵。目前我在R-chunk中使用kable
,如果最终产品是HTML文件,那就非常好用。
我的R-chunk看起来像:
```{r}
library (knitr)
data (cars)
kable (head (cars))
```
从控制台调用kable
时,我得到了我想要的管道表:
| speed| dist|
|-----:|----:|
| 4| 2|
| 4| 10|
| 7| 4|
| 7| 22|
GitHub很好地显示了 。
但是,knit('myfile.Rmd')
在myfile.md
中生成的内容(从R-chunk调用kable
时)是一个简单的表
speed dist
------ -----
4 2
4 10
7 4
7 22
GitHub很好地显示了 。
有没有办法让我的降价文件中的表与GitHub风味的降价兼容?也许有knitr
或kable()
选项,我不知道?或者可能有kable
的替代方法可以达到预期的效果吗?
答案 0 :(得分:4)
Pandoc可以使用-t markdown_github
输出到github风格的降价标记。使用knitr:
library(knitr)
pandoc('input.md', format='markdown_github')
答案 1 :(得分:4)
您可以通过format
的{{1}}参数指定表格格式,例如
kable()
或者,如果您想全局设置此选项,则可以
kable(head(mtcars), format = 'markdown')