Cytoscape:动态网络可视化

时间:2015-02-19 19:46:13

标签: r igraph cytoscape

我正在使用R通过RESTful API将图形对象(igraph)发送到Cytoscape - 这非常有效。 我遇到的麻烦是图表是动态的,每个节点/边缘都有一个创建/结束日期,是否可以在Cytoscape中进行动态可视化?我尝试过使用多种不同的插件,包括dynNetwork,但这会查找XGMML格式的网络文件。

有没有人遇到过Cytoscape插件来做这类工作?

或者失败了,是否有一个R包来输出XGMML格式的igraph对象?

非常感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我不了解Cytoscape,但可以使用which -a conda ndtv软件包来显示R中的动态网络(免责声明,我是软件包作者)< / p>