我正在使用R通过RESTful API将图形对象(igraph)发送到Cytoscape - 这非常有效。 我遇到的麻烦是图表是动态的,每个节点/边缘都有一个创建/结束日期,是否可以在Cytoscape中进行动态可视化?我尝试过使用多种不同的插件,包括dynNetwork,但这会查找XGMML格式的网络文件。
有没有人遇到过Cytoscape插件来做这类工作?
或者失败了,是否有一个R包来输出XGMML格式的igraph对象?
非常感谢。
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我不了解Cytoscape,但可以使用which -a conda
和ndtv
软件包来显示R中的动态网络(免责声明,我是软件包作者)< / p>