错误:嵌套函数中的“找不到对象”

时间:2015-02-19 08:50:27

标签: r function logistf

我正在使用logistf::logistflogistf::forward函数编写函数。我将使用sex2包中的logistf给出最小的工作示例。

data(sex2)
fwSel <- function(datamod) {
  fitnull <- logistf(case ~ 1, data = datamod, pl = FALSE) 
  fw <- forward(fitnull)
  return(fw)
}
fwSel(sex2)

我得到以下输出:

  

第0步:启动模型

     

is.data.frame(data)中的错误:object&#39; datamod&#39;没找到。。

有人对此有解释吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

这是您可以在R中获得的典型错误。已经再次询问它,不幸的是,它根据不同功能在不同环境中的工作方式以及函数如何根据parent.env的使用情况尝试查找数据而发生或parent.frame。这可能是两个问题之一:

  • 懒惰的评价问题:
    尝试在force(datamod)函数之前使用logistf,因为您的自定义函数中当前未评估您的数据片。如果存在以下问题,则可能无效:
  • 您的数据存储区数据集存在于您的函数执行环境中。如果函数链中的一个函数使用对parent.frame()的调用或对parent_env()的调用,这会导致问题,因为R在不同环境中查找数据的方式不同。解决这个问题的唯一方法是在全球环境中启动数据仓,即:

data(sex2)
datamod <- sex2
fwSel <- function(datamod) {
    fitnull <- logistf(case ~ 1, data = datamod, pl = FALSE) 
    fw <- forward(fitnull)
    return(fw)
}
fwSel(sex2)

这肯定会有效,因为无论如何都会搜索全球环境。

我发现这个link是了解parent.envparent.frame的不同之处的绝佳方式,以及如何使用这两个内部函数可能会导致问题,例如您所面临的问题。

我根据链接中的函数创建了一个新示例,它完全展示了您的问题:

f = function() {
  print(c(f=environment(), defined_in=parent.env(environment()),  
    called_from=parent.frame()))

  #search for mydata in calling environment
  try(print(get('mydata',env=parent.frame())))  

  #search for mydata in parent evnironment
  try(print(get('mydata',env=parent.env(environment())))) 
  }

g = function() {
  mydata <- c(1,2,3)
  print(c(g=environment(), f()))
  }   

> g()
$f
<environment: 0x0000000030868df8>

$defined_in
<environment: R_GlobalEnv>

$called_from
<environment: 0x000000003086a360>

#the first get works perfect
[1] 1 2 3       

#the second produces an error
Error in get("mydata", env = parent.env(environment())) : 
  object 'mydata' not found

$g
<environment: 0x000000003086a360>

正如您在上面使用get看到调用环境有效,而在父环境中使用get失败并产生错误。这也是(可能)在您的函数中发生的事情。