Question

我有一个奇怪的行为与r markdown和读取txt文件...只在Windows 7机器上。我的Mac上没有问题，还没有在Windows 8上检查过它。

我有一个基本的降价文件

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title: "Untitled"
output: html_document
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```{r global_options, message=FALSE}
setwd('E:/Falk')
list.files(pattern='test')
```

```{r global variable settings, eval=TRUE}
pg_filename <- 'test.txt' 
pg <- read.delim (pg_filename)
```

如果我在最后一个块中设置eval = FALSE，则会创建html并使用我的test.txt文件获取列表。如果我设置eval = TRUE，我收到一条错误消息，表示无法找到该文件：

Quitting from lines 11-13 (Preview-2b2464944991.Rmd) 
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> read.delim -> read.table -> file

Execution halted

如果我将所有内容放在一个块中，则会创建html。

有谁知道问题是什么？

修改也许我不够清楚。我知道eval = TRUE和FALSE之间的区别但我不知道在markdown中测试某些内容的方法，如果有错误消息，但一切都在块中工作正常。

所以，为了更清楚：

WORKS：

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title: "Untitled"
output: html_document
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```{r}
setwd('E:/Falk')
list.files(pattern='test')
pg_filename <- 'test.txt' 
pg <- read.delim (pg_filename)
```

不工作：

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title: "Untitled"
output: html_document
---
```{r}
setwd('E:/Falk')
list.files(pattern='test')
```

```{r}
pg_filename <- 'test.txt' 
pg <- read.delim (pg_filename)
```

Answer 1

You cannot use setwd in knitr, and you shouldn’t use it in your R code anyway.您需要专门使用相对路径。

特别是，setwd在其当前块之外没有任何影响 - 其他块将在文档的路径中进行评估，而不是在设置路径中进行评估。

通常，setwd只应由用户在交互式会话中使用，或者在项目配置文件（本地.Rprofile文件中）中用于设置项目目录。 It has no place in scripts.

setwd的最直接等价物是使用knitr选项root.dir：

opts_knit$set(root.dir = 'some/dir')

R Markdown无法找到文件，但执行块工作

1 个答案: