Question

嗨我希望我的文件一行一行地读取坐标：

（124,125）

（160,230）

我需要逐行读取（x，y），并获取值并运行我的模型的细化。我想自动完成，而不是手动操作。

我有这个代码：

#! /usr/bin/env python
import sys
import os

old_stdout = sys.stdout
log_file = open ('listprueba.log', "w")
sys.stdout = log_file

with open('list.log') as f:
            for line in f:
                a,b = map(int,line.translate(None,"()[],").split())
                ("x = {}\ny = {}".format(a,b))
                print (a, b)


sys.stdout = old_stdout
log_file.close()

def readfile(filename):
    # opens file, reads contents, and splits it by newline
    with open(filename, 'r') as f:
        data = f.read().split('\n')

    # iterates through data and converts each string to a tuple
    for item in range(len(data)):
        parentesisi = data[item].find('(')
        coma = data[item].find(',')
        parentesisd = data[item].find(')')
        data[item] = (int(data[item][parentesisi+1:coma]), int(data[item][coma+1:parentesisd]))

    return data

def main():
    for i in readfile('coordinates.log'):
        x=i[0]
        y=i[1]

if __name__ == '__main__':
    main()

这部分没关系，它是程序的一部分

log.verbose()
env = environ()
class MyLoop(loopmodel):

 # This routine picks the coordinates to be refined by
            def select_loop_atoms(self):
# coordinate insertion
                return selection(self.residue_range(x, y)

我有这个错误：

ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

我只是想读取具有坐标（124,125）的第一行并且在x，y中存储值，并运行refinament。然后，返回具有坐标（160,230）的第2行，并相对于我的文件的长度执行相同的操作。

如何改进此代码？

非常感谢

Answer 1

看起来你正试图在剥离之前转换一条线，所以你要用str.split在某处拆分一个空字符串。试试这个：无论如何它看起来更漂亮。

import ast

with open('path/to/file.txt') as inf:
    for line in inf:
        line = line.strip() # strip the line first
        if not line:
            continue # skip blank lines
        x,y = ast.literal_eval(line)
        # the format (x, y) is a literal tuple. Treat it that way

如果你想要一个所有元组的列表：

with open('path/to/file.txt') as inf:
    result = [ast.literal_eval(line) for line in inf if line.strip()]

如何迭代列表并逐行走python文件？

1 个答案: