使用rmarkdown / knitr保存所有代码直到结束

Question

我希望能够使用knitr / rmarkdown生成一个文档，将所有输出保存在一起，但将代码保留到最后，理想情况下作为引用的脚注（即每个数字的代码或可以使用脚注在附录中查找输出。这可能吗？

Answer 1

如果我理解你的意思。 您可以向原始代码块添加标签，然后使用ref.label属性引用它，并阻止其使用eval=FALSE进一步执行。

例如：

 # Header
 Bla bla ...
 ````{r plot1,echo=FALSE}
 x = rnorm(100,10,5)
 y = rnorm(100,10,5)
 plot(x,y)
 ````

 # Appendix

 Code chunk:
 ````{r ref.label="plot1",eval=FALSE}
 ```

执行第一个块（没有回声）并显示一个数字，第二个块只是回显第一个块的源。

Answer 2

一种解决方案是在最后添加此块。

{r ref.label=knitr::all_labels(), echo=TRUE, eval=FALSE} 

然后，您将所有代码一起进行评估。