Question

我正在尝试安装软件包＆＃34; rjags＆＃34;在R中但遇到以下错误：

Loading required package: rjags

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rjags', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/rjags/libs/rjags.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/rjags/libs/rjags.so, 10): Symbol not found: __ZN5RangeC1ERKSt6vectorIiSaIiEES4_
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/rjags/libs/rjags.so
  Expected in: /usr/local/lib/libjags.3.dylib
in /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/rjags/libs/rjags.so
Error: package ‘rjags’ could not be loaded

我已经在我的Mac上安装了JAGS（运行Mavericks），我正在运行R-3.1.2。我已按照此site的建议尝试使用devtools包从网址进行安装：

install_url("http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/rjags/3/rjags_3-2.tar.gz",
                      args="--configure-args='--with-jags-include=/Users/casallas/homebrew/opt/jags/include/JAGS        
                                              --with-jags-lib=/Users/casallas/homebrew/opt/jags/lib'
                            "
                      )

我还查看了此other site上的说明，尝试了不同版本的JAGS并收到相同的错误。我不知道接下来会尝试什么，我确信解决方案很简单。有没有人有任何见解？非常感谢！

Answer 1

我发现虽然我无法从网址安装rjags，但如果我从计算机上安装了源代码，那么我就成功了。我通过从here（对我来说是rjags_3-14.tgz）下载相应的包来执行此操作并运行以下命令：

install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")

Answer 2

错误：

    Symbol not found: __ZN5RangeC1ERKSt6vectorIiSaIiEES4_

（几乎）总是由Mavericks构建的R（实际上是rjags）和Snow Leopard构建的JAGS（反之亦然）之间的标准库之间的不匹配引起。有关详细信息，请参阅https://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/JAGS/3.x/Mac%20OS%20X/

上的说明

我猜测自己从源代码编译包是因为它与JAGS正在使用的标准库的版本匹配，但是这将不再匹配R正在使用的版本（虽然我不确定这是否是一个主要问题，不建议）。你最好匹配R和JAGS的构建，并使用CRAN中预先构建的rjags库。

有趣的是，你说你已经尝试了两种JAGS版本，但我建议你再试一次：

1）在R中使用.Platform $ pkgType来确认你是使用mac.binary（SL）还是mac.binary.mavericks（Mavericks） - 或者没有从CRAN重新安装R的Mavericks二进制文件

2）退出R

3）重新安装适当版本的JAGS

4）重新打开R并从CRAN重新安装rjags库

5）尝试库（rjags）

如果这不起作用，您可以提供更多信息，以便我可以尝试跟踪JAGS构建可能出现的问题吗？

谢谢，

马特

在OSX Mavericks上安装r中的rjags

2 个答案: