我完全复制了Cython documentation for wrapping C++ classes中给出的示例代码。我可以使用rect.so
和distutils
方法成功构建和导入cythonize()
扩展名,即:
将以下指令放在rect.pyx
的顶部:
# distutils: language = c++
# distutils: sources = Rectangle.cpp
编写包含此内容的setup.py
文件:
from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
setup(
name = "rectangleapp",
ext_modules = cythonize('*.pyx'),
)
调用
$ python setup.py build_ext --inplace
然而,当我在Cython中包装C代码时,我经常发现从命令行手动编译单个扩展更方便,即:
使用命令行Cython编译器生成.c
代码
$ cython foo.pyx
使用gcc
:
$ gcc -shared -fPIC -O3 -I /usr/lib/python2.7 -L /usr/lib/python2.7 \
foo.c -lpython2.7 -o foo.so
我尝试使用相同的流程来构建上面的rect.so
示例:
$ cython --cplus rect.pyx
$ g++ -shared -fPIC -O3 -I /usr/lib/python2.7 -L /usr/lib/python2.7 \
rect.cpp -lpython2.7 -o rect.so
Cython和g ++编译步骤似乎都成功了 - 我没有得到任何命令行输出,最后我建立了rect.so
。但是,当我尝试导入模块时,我收到undefined symbol
错误:
In [1]: import rect
---------------------------------------------------------------------------
ImportError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-ba16f97c2145> in <module>()
----> 1 import rect
ImportError: ./rect.so: undefined symbol: _ZN6shapes9Rectangle9getLengthEv
手动编译包装C ++类的Cython代码的正确步骤是什么?
答案 0 :(得分:7)
这里的问题是你说某个地方你会提供一个名为Rectangle的类的定义 - 示例代码说明
cdef extern from "Rectangle.h" namespace "shapes":
cdef cppclass Rectangle:
...
但是,当您编译库时,您没有提供Rectangle的代码或包含它的库,因此rect.so
不知道在哪里可以找到这个Rectangle类。
要运行代码,必须先创建Rectangle对象文件。
gcc -c Rectangle.cpp # creates a file called Rectangle.o
现在,您可以创建一个库来动态链接,或者将目标文件静态链接到rect.so
。我将首先介绍静态链接,因为它最简单。
gcc -shared -fPIC -I /usr/include/python2.7 rect.cpp Rectangle.o -o rect.so
请注意,我没有为python包含库。这是因为您希望您的库由python解释器加载,因此加载库时,进程已经加载了python库。除了提供rect.cpp
作为来源之外,我还提供了Rectangle.o
。因此,让我们尝试使用您的模块运行程序。
<强> run.py 强>
import rect
print(rect.PyRectangle(0, 0, 1, 2).getLength())
不幸的是,这会产生另一个错误:
ImportError: /home/user/rectangle/rect.so undefined symbol: _ZTINSt8ios_base7failureE
这是因为cython需要c ++标准库,但是python没有加载它。您可以通过将c ++标准库添加到rect.so
gcc -shared -fPIC -I/usr/include/python2.7 rect.cpp Rectangle.o -lstdc++ \
-o rect.so
再次运行run.py
,一切正常。但是,rect.so
的代码大于它需要的代码,特别是如果您生成依赖于相同代码的多个库。您可以动态链接Rectangle代码,也可以将其作为库。
gcc -shared -fPIC Rectangle.o -o libRectangle.so
gcc -shared -fPIC -I/usr/include/python2.7 -L. rect.cpp -lRectangle -lstdc++ \
-o rect.so
我们将Rectangle代码编译到当前目录中的共享库中并提供-L.
,以便gcc知道在当前目录和-lRectangle
中查找库,因此gcc知道要查找Rectangle库。最后,为了能够运行您的代码,您必须告诉python Rectangle库所在的位置。在运行python之前输入
export LD_LIBRARY_PATH="/home/user/rectangle" # where libRectangle.so lives
您可以使用shell脚本确保每次运行程序之前都执行此操作,但这会使事情变得更加混乱。最好只是坚持静态链接矩形。