Rmarkdown pdf"错误打开文件:2" R-闪亮

时间:2015-02-06 11:35:00

标签: r pdf shiny r-markdown

我想使用Rmarkdown文件创建一个pdf文档作为我的应用程序的报告。 我这里有两个问题。

首先:创建了pdf文件,但它是空的,因为我收到了这个错误:

Output created: report.pdf
Error opening file: 2
Error reading: 9 

以下是我的闪亮应用的简化代码:

Server.R

 library(shiny)
 library(drsmooth)
 library(shinyBS)
 library(knitr)
 library(rmarkdown)

 shinyServer(function(input, output,session) {
         ...get input from user...

output$report <- downloadHandler(
filename <- 'report.pdf',
content <- function(file) {
  rmarkdown::render('report.Rmd')
},

contentType = 'application/pdf')
})

output$tb <- renderUI({
    if(is.null(data1())) {
tags$p(tags$h1("Welcome!")
} else {
 tabsetPanel(
 tabPanel("Preliminary stats")
 tabPanel("Report",downloadButton('report'))
}

report.Rmd (这只是R studio提供的模板,所以我的应用程序的输入部分很重要)

---
title: "REPORT"
author: " "
date: "`r Sys.Date()`"
output: pdf_document
---

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r}
summary(cars)

```

You can also embed plots, for example:

```{r, echo=FALSE}
plot(cars)
```

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

当我点击下载按钮时,我可以从Rstudio控制台的输出中看到输出report.pdf已创建,但它是空的,下载没有开始。有什么想法吗?

第二个问题只有在你能帮助我解决问题时才有意义。 我可以在Rmarkdown文件中使用应用程序中创建的Rshiny对象来生成pdf报告(而不是html)吗?

如有任何进一步的信息或澄清,请告诉我。

提前致谢,

丹尼尔

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