我有一种特定形式的数据,类似于前面描述的数据。 我有200个人,他们的基因组。现在,他们在田间互动,一段时间后,他们可以占据别人的基因组,或者可能会死亡。 因此,我有数据,
At time 400, Guy134 took genome from Guy156
At time 400, Guy96 took genome from Guy145
At time 800, Guy145 took genome from Guy178
...
...
因此,发生的事情是Guy134从156获取基因组,而他的 基因组永远丢失了,而Guy145从178获取基因组,但他的 基因组没有丢失,但现在存在于失去基因组的Guy96中。
现在我需要以图形(树状)方式跟踪基因组Descendance。获得如下内容:
现在,如果有人能提供任何帮助,我将不得不提供任何帮助。任何软件,包,代码,任何东西都会有所帮助。我认为我必须从头开始,如果已经不存在可以做到这一点的事情。什么是最好的软件或包来做这种事情。 另外,我想知道是否有不同的,更好的方式来表示这些数据。
我是一名生物学家,不是专家,但熟悉MATLAB,有点Python,还有一些shell脚本。