使用Python包hdf5storage将新变量添加到.mat文件中

时间:2015-02-01 17:21:27

标签: python matlab hdf5 hdf5storage

是否可以使用Python包hdf5storage将新变量添加到.mat文件(v7.3)?


示例:

我在Matlab写道:

test = {'Hello', 'world!'; 'Good', 'morning'; 'See', 'you!'};
save('data.mat', 'test', '-v7.3') % v7.3 so that it is readable by h5py

enter image description here

在Python中,我想向data.mat添加一个新变量。我该怎么做才能实现以下目标:

enter image description here

我试过了:

import hdf5storage # get code on https://pypi.python.org/pypi/hdf5storage/0.1.3
import numpy as np

matcontent = {}
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20]) # each key must be a unicode string
hdf5storage.write(matcontent, '.', 'data.mat', matlab_compatible=True)

但它会覆盖data.mat而不是添加新变量。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您正在创建新数据,然后将新数据写入文件。那会覆盖文件。您需要加载原始.mat文件,附加到该文件,然后再次保存。

import hdf5storage
import numpy as np

matcontent = hdf5storage.loadmat('data.mat')
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20])
hdf5storage.savemat('data.mat', matcontent)

然后在Matlab

>> whos -file data.mat
      Name              Size            Bytes  Class    Attributes

      some_numbers      1x3                24  int64              
      test              3x2               730  cell   

答案 1 :(得分:1)

到目前为止,我知道这是不可能的。 TheBlackCat提供的答案并不适用,因为您正在重写文件。我倾向于拥有非常大的matlab文件,我通常不想完全读取,而是选择性地读取或写入。这是.mat文件中使用的基础HDF5格式的最大优势(连同引用)。 python包hdf5storage仍然是0.xx版本所以我想这将在未来版本中出现。