我正在尝试在cygwin上安装samtools（）。
我遵循了各种技巧here和here，但看起来我的问题是我无法使用pthread。
gcc已安装并正常工作，zlib已安装并正常工作且ncurses已安装并正常工作+所有内容已添加到$ PATH ...但是当我运行make并且它到达Makefile中的以下行：
gcc -pthread $(LDFLAGS) -o $@ $(AOBJS) libbam.a $(HTSLIB) $(LDLIBS) $(LIBCURSES) -lm -lz
然后它会抛出一个错误，因为它无法识别unix命令-pthread。现在... pthread应该是cygwin中默认安装的一部分，所以我不明白为什么这不起作用......
任何提示都会很棒！
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gg的选项-pthread在Cygwin上不可用。