在R中运行glmnet包，得到错误＆＃34;缺少需要TRUE / FALSE的值＆＃34;，可能是由于缺少值？

Question

我正在尝试使用glmnet包中的glmnet来运行LASSO回归。

我使用以下命令：

library(glmnet)
glmnet(a,b,family="binomial",alpha=1)

我收到了错误：

> Error in if (!all(o)) { : missing value where TRUE/FALSE needed

a是一个矩阵，带有数值。 b是一个以因子为值的向量。

但是，b有一些缺失值。我怀疑这可能是造成错误的原因。但是，我没有看到在glmnet文档中排除NA的选项。

Answer 1

由于glmnet不接受带公式的完整数据框（因此没有na.omit），但使用单独的响应和预测矩阵，您必须在b中找到哪些值缺少，然后将预测矩阵子集以排除这些行。

library(glmnet)

set.seed(123)
a <- matrix(rnorm(100*20),100,20)
b <- as.factor(sample(0:1,100,replace = TRUE))

b[10] <- NA

na_index <- is.na(b)
res <- glmnet(a[!na_index, ], b[!na_index], family = "binomial", alpha = 1)