（在os x 10.10.1上）我试图在python脚本中使用配对端合并（Casper）。我使用os.system（不想使用subprocess或pexpect模块）。在我的脚本中，这是不起作用的行：
os.system("casper %s %s -o %s"%(filein[0],filein[1],fileout))
#filein[0]: input file 1
#filein[1]: input file 2
#fileout: output prefix (default==casper)
启动脚本后，只解释此命令的2个第一个字符串参数，但不解释第3个字符串参数，从而导致输出文件具有默认前缀名称。由于我的函数迭代了很多fastq文件，因此它们都被合并在一个＆＃34; casper.fastq＆＃34;文件。 我试图弄乱那些不起作用的命令部分（在-o之后），放置无意义的字符串并且仍然执行时没有错误和默认输出，这里是＆＃34;搞砸了线＆＃34;：
os.system("casper %s %s -ldkfnlqdskgfno %s"%(filein[0],filein[1],fileout))
有人可以帮助理解发生了什么事吗？
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