Rscript不能通过perl工作

Question

我正在尝试运行

Rscript myRfile.R

来自perl脚本。 perl脚本编写自定义myRfile.R，然后执行

`Rscript myRfile.R`;

或

system("Rscript myRfile.R")

它们都失败了，给了我所有类型的错误，例如：

Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : cannot open the connection
Calls: analyze_FDR ... rsa.load -> load -> load.default -> <Anonymous> -> readChar
In addition: Warning message:
In readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) :
  cannot open compressed file '/home/myusername/someinput_file.Rbin', probable reason 'No such file or directory'
Execution halted

现在，这里发生了两件奇怪的事情：

1. 检查并发现 /home/myusername/someinput_file.Rbin 存在。完全一样。

2. 从 bash 执行脚本时（而不是 Perl ）

   Rscript myRfile.R

一切正常。没有错误。

我不知道为什么会这样。我尝试更改Perl的默认shell，我试图搞乱env变量，但无济于事。我的直觉告诉我它与环境变量有关，但对于我的生活，我无法指出这个问题。

请帮助，也许你在整个编码过程中受到祝福，并且你的虫子可能会恐惧地逃跑，

祝福， R上。