我有一个数据框,如果它是空的,我想测试真的很快。我知道没有行或有整数(没有缺失值)。到目前为止,我已经测试了五种不同的选项(见下文)。有人有更快的解决方案吗?
df <- data.frame(a = integer(0), b = integer(0), c = integer(0))
fa <- function(){
nrow(df) > 0
}
fb <- function(){
any(dim(df)[1L])
}
fc <- function(){
(dim(df)[1L]) != 0
}
fd <- function() {
any(.subset2(df, 1)[1])
}
fe <- function() {
any(.subset2(df, 1))
}
library(microbenchmark)
microbenchmark(fa(), fb(), fc(), fd(), fe(), times = 1000)
结果:
> microbenchmark(fa(), fb(), fc(), fd(), fe(), times = 1000)
Unit: nanoseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
fa() 5664 6725 8672.462 6725 11680 47777 1000 cd
fb() 6017 7078 8979.645 7079 12034 58041 1000 d
fc() 6017 6372 8492.680 6725 11679 25127 1000 c
fd() 1062 1770 2214.170 1771 2832 14511 1000 b
fe() 354 1062 1359.498 1063 1770 12741 1000 a
答案 0 :(得分:6)
由于您测试的大多数对象都不可能是空的,因此您应该更关注函数在非空数据框架上的计时。您还应该编译它们以了解它们在包中的执行方式。
library(microbenchmark)
library(compiler)
fa <- cmpfun({function(){
nrow(df) > 0L
}})
fb <- cmpfun({function(){
any(dim(df)[1L])
}})
fc <- cmpfun({function(){
dim(df)[1L] != 0L
}})
fd <- cmpfun({function() {
any(.subset2(df, 1L)[1L])
}})
fe <- cmpfun({function() {
any(.subset2(df, 1L))
}})
ff <- cmpfun({function() {
length(.subset2(df, 1L)) > 0L
}})
fg <- cmpfun({function() {
as.logical(length(.subset2(df, 1L)))
}})
对空data.frame的测试显示所有方法大致相同。
df <- data.frame(a = integer(0), b = integer(0), c = integer(0))
microbenchmark(fa(), fb(), fc(), fd(), fe(), ff(), fg(), times = 1000)
# Unit: nanoseconds
# expr min lq median uq max neval
# fa() 5685 5969.0 6165.0 6608.5 20515 1000
# fb() 6147 6443.0 6651.0 7214.0 18117 1000
# fc() 5726 5984.0 6152.0 6457.5 38404 1000
# fd() 1210 1411.0 1573.0 1764.5 4933 1000
# fe() 635 871.0 1003.0 1105.5 10225 1000
# ff() 513 727.5 861.5 941.0 5691 1000
# fg() 681 868.5 981.5 1080.0 2982 1000
对非空数据框架的测试显示,其中一个功能表现非常糟糕,其余功能大致相同。
df <- data.frame(a = integer(1e6), b = integer(1e6), c = integer(1e6))
microbenchmark(fa(), fb(), fc(), fd(), fe(), ff(), fg(), times = 1000)
# Unit: nanoseconds
# expr min lq median uq max neval
# fa() 6569 7142 8782.0 12364.5 46749 1000
# fb() 7034 7682 9334.5 18334.0 53172 1000
# fc() 6539 7110 8453.5 20585.5 49912 1000
# fd() 1171 1585 2507.5 5021.5 17641 1000
# fe() 4340209 4413042 4460973.5 5468688.5 26045766 1000
# ff() 637 984 1489.0 3646.5 14212 1000
# fg() 767 1161 2401.0 4078.5 236958 1000