grep基于一个特定列中的模式

时间:2015-01-22 22:18:47

标签: r

我想要在V21列中grep包含字符串hsa的行。 试过这样的事情:grep(pattern = "hsa",file$V21)然而,这不起作用。

  V2                      V10                 V21
1 16 AGCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
2 16 AGTGTGAGTTCTACCATTGCCAAA                    
3 16   AGTGAATTCTACCAGTGCCATA                    
4  0   TAGCTTATCAGACTGATGTTGA                    
5 16  GCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
6  0   TGAGGTAGTAGATTGTATAGTT  XF:Z:hsa-let-7f-5p

输出:

      V2                      V10                 V21
    1 16 AGCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
    5 16  GCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
    6  0   TGAGGTAGTAGATTGTATAGTT  XF:Z:hsa-let-7f-5p

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