通过从str读取来理解和访问嵌套对象

时间:2015-01-22 18:27:46

标签: r bioconductor

嗨我有一个嵌套对象,我认为它包含表格。我用str来看看它的样子,

> str(test)
Formal class 'CuffData' [package "cummeRbund"] with 5 slots
  ..@ DB     :Formal class 'SQLiteConnection' [package "RSQLite"] with 5 slots
  .. .. ..@ Id                 :<externalptr> 
  .. .. ..@ dbname             : chr "C:/temp/cuffData.db"
  .. .. ..@ loadable.extensions: logi TRUE
  .. .. ..@ flags              : int 6
  .. .. ..@ vfs                : chr ""
  ..@ tables :List of 6
  .. ..$ mainTable     : chr "genes"
  .. ..$ dataTable     : chr "geneData"
  .. ..$ expDiffTable  : chr "geneExpDiffData"
  .. ..$ featureTable  : chr "geneFeatures"
  .. ..$ countTable    : chr "geneCount"
  .. ..$ replicateTable: chr "geneReplicateData"
  ..@ filters: list()
  ..@ type   : chr "genes"
  ..@ idField: chr "gene_id"

然而当我试图阅读表mainTable时,我得到的就是这个,

> test@tables$mainTable
[1] "genes"
  • 有什么方法可以阅读这张表中的内容吗?
  • 不确定我是否正确解释str输出。我是一个新手,我也想知道是否有一个很好的教程如何在R中解释像这样的对象?例子会更好。

提前多谢你。 阿迪

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