我一直在使用Cramtools压缩bam文件，但我没有得到我希望的结果。
如果我尝试无损压缩
java -jar cramtools.jar cram -I file.bam -O file.cram -R genome.fa --capture-all-tags --lossless-quality-score
它会将文件转换为cram。虽然当我解压缩bam文件时，它会发生巨大变化。读数已更改，但质量得分未更改。解压缩的bam文件通常小于原始文件，即使添加到标头也是如此。如果我之后压缩和解压缩该文件，它将不会像第一次那样完全改变。
有人可以向我解释如何正确使用cramtools吗？或者这是预期的产出？