Apache Spark不如Scikit Learn准确吗?

时间:2015-01-21 20:29:00

标签: apache-spark machine-learning scikit-learn linear-regression

我最近一直在努力了解Apache Spark作为Scikit Learn的替代品,但在我看来,即使在简单的情况下,Scikit也会以比Spark快得多的速度收敛到精确模型。 例如,我使用以下脚本为非常简单的线性函数(z = x + y)生成了1000个数据点:

from random import random

def func(in_vals):
    '''result = x (+y+z+w....)'''
    result = 0
    for v in in_vals:
        result += v
    return result

if __name__ == "__main__":
    entry_count = 1000
    dim_count = 2
    in_vals = [0]*dim_count
    with open("data_yequalsx.csv", "w") as out_file:
        for entry in range(entry_count):
            for i in range(dim_count):
                in_vals[i] = random()
            out_val = func(in_vals)
            out_file.write(','.join([str(x) for x in in_vals]))
            out_file.write(",%s\n" % str(out_val))

然后我运行了以下Scikit脚本:

import sklearn
from sklearn import linear_model

import numpy as np

data = []
target = []
with open("data_yequalsx.csv") as inFile:
    for row in inFile:
        vals = row.split(",")
        data.append([float(x) for x in vals[:-1]])
        target.append(float(vals[-1]))

test_samples= len(data)/10

train_data = [0]*(len(data) - test_samples)
train_target = [0]*(len(data) - test_samples)
test_data = [0]*(test_samples)
test_target = [0]*(test_samples)
train_index = 0
test_index = 0
for j in range(len(data)):
    if j >= test_samples:
        train_data[train_index] = data[j]
        train_target[train_index] = target[j]
        train_index += 1
    else:
        test_data[test_index] = data[j]
        test_target[test_index] = target[j]
        test_index += 1

model = linear_model.SGDRegressor(n_iter=100, learning_rate="invscaling", eta0=0.0001, power_t=0.5, penalty="l2", alpha=0.0001, loss="squared_loss")
model.fit(train_data, train_target)
print(model.coef_)
print(model.intercept_)

result = model.predict(test_data)
mse = np.mean((result - test_target) ** 2)
print("Mean Squared Error = %s" % str(mse))

然后这个Spark脚本:(使用spark-submit,没有其​​他参数)

from pyspark.mllib.regression import LinearRegressionWithSGD, LabeledPoint
from pyspark import SparkContext

sc = SparkContext (appName="mllib_simple_accuracy")

raw_data = sc.textFile ("data_yequalsx.csv", minPartitions=10) #MinPartitions doesnt guarantee that you get that many partitions, just that you wont have fewer than that many partitions
data = raw_data.map(lambda line: [float(x) for x in line.split (",")]).map(lambda entry: LabeledPoint (entry[-1], entry[:-1])).zipWithIndex()
test_samples= data.count()/10

training_data = data.filter(lambda (entry, index): index >= test_samples).map(lambda (lp,index): lp)
test_data = data.filter(lambda (entry, index): index < test_samples).map(lambda (lp,index): lp)

model = LinearRegressionWithSGD.train(training_data, step=0.01, iterations=100, regType="l2", regParam=0.0001, intercept=True)
print(model._coeff)
print(model._intercept)

mse = (test_data.map(lambda lp: (lp.label - model.predict(lp.features))**2 ).reduce(lambda x,y: x+y))/test_samples;
print("Mean Squared Error: %s" % str(mse))

sc.stop ()

奇怪的是,火花给出的误差比Scikit给出的误差大一个数量级(分别为0.185和0.045),尽管两个模型具有几乎相同的设置(据我所知) 据我所知,这是使用SGD进行非常少的迭代,因此结果可能会有所不同,但我不会认为它会出现如此大的差异或如此大的错误,特别是考虑到非常简单的数据。


我在Spark中有什么误解吗?它配置不正确吗?当然我应该得到一个比这更小的错误?

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

SGD,代表随机梯度下降,是一种在线凸优化算法,因此非常难以并行化,因为它每次迭代进行一次更新(有更智能的变体,例如带有小批量的SGD,但仍然不是很适合并行环境。

另一方面,批处理算法,如L-BFGS,我建议你使用Spark(LogigisticRegressionWithLBFGS),可以很容易地并行化,因为它在每个时期进行迭代(它需要查看所有数据点,计算每个点的损失函数的值和梯度,然后执行聚合以计算完整的梯度。)

Python在一台机器上运行,因此SGD表现良好。

顺便说一句,如果你查看MLlib代码,相当于scikit learn的lambda是lambda /数据集的大小(mllib优化1/n*sum(l_i(x_i,f(y_i)) + lambda而scikit学习优化sum(l_i(x_i,f(y_i)) + lambda

答案 1 :(得分:2)

由于Spark是并行化的,因此当计算正在进行时,每个节点都需要能够独立于其他节点工作,以避免节点之间的[时间]昂贵的混乱。因此,它使用一个称为随机梯度下降的过程来逼近最小值,它遵循局部梯度向下。

&#39;确切&#39;解决[简单,最小二乘]回归问题的方法包括求解矩阵方程。这可能是Scikit-Learn所做的,所以在这种情况下它会更准确。

权衡是,对于大小为N的方阵,求解矩阵方程通常会缩放为N ^ 3,这对于大型数据集而言很快变得不可行。 Spark交换计算能力的准确性。与任何机器学习过程一样,您应该在整个算法中构建大量的健全性检查,以确保上一步的结果有意义。

希望这有帮助!