从gdb显示Rcpp :: NumericMatrix的元素

时间:2015-01-21 17:47:47

标签: c++ r gdb rcpp

我正在尝试使用gdb来调试使用Rcpp功能的简单C ++子例程。我使用选项-O0 -g构建我的子程序foo.cpp。我使用R -d gdb启动R. 我使用dyn.load(“foo.so”)加载子程序,然后用.Call(“foo”,X)调用子程序。没有问题。当我在gdb中输入子程序时,我可以打印标准C ++类型,例如“print i”,其中i是int。但是,我无法打印Rcpp :: NumericMatrix xout的元素。我试过了

print xout(1,1)

以及

打印R_PV(xout(1,1))

有谁知道怎么做?

我的C ++代码是:

#include <iostream>
#include <Rcpp.h>

RcppExport SEXP foo(SEXP x){
    using namespace Rcpp;
    NumericMatrix xin = NumericMatrix(x);
    int nrow = xin.nrow();
    int ncol = xin.ncol();
    NumericMatrix xout(nrow, ncol);
    for(int j = 0; j<ncol; j++) {
      xout(0,j) = xin(0,j);
      for (int i=1; i<nrow; i++) {
          if (ISNA(xin(i,j)))
           xout(i,j) = xout(i-1,j);
          else
           xout(i,j) = xin(i,j);
      }
    }

    return(xout);
}

从命令行,我运行:

R CMD SHLIB foo.cpp

然后我使用

启动R.
R -d gdb

我在foo

添加一个断点
b foo

然后我开始R:

R

在R中,我输入

dyn.load("foo.so")
X =matrix(rnorm(9),3)
.Call("foo",X)

从gdb命令行输入

print xin

并获得:

$1 = {<Rcpp::Vector<14>> = {<Rcpp::RObject> = {_vptr.RObject = 0x7fff8df4b410, 
      m_sexp = 0x2567f20}, <Rcpp::VectorBase<14, true, Rcpp::Vector<14> >> = {<Rcpp::traits::expands_to_logical__impl<14>> = {<No data fields>}, <No data fields>}, <Rcpp::internal::eval_methods<14>> = {<No data fields>}, cache = {
      start = 0x31e03c39b0}}, <Rcpp::MatrixBase<14, true, Rcpp::Matrix<14> >> = {<Rcpp::traits::expands_to_logical__impl<14>> = {<No data fields>}, <No data fields>}, nrows = -537925942}

我希望能够从gdb访问xin(1,1),例如,

print xin(1,1)

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