我有2个csv文件。文件A,包含多列。文件B,有一列。 例如:
档案A:
chr1 100000 100022 A C GeneX
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ
档案B:
GeneY
GeneZ
我希望我的输出为:
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ
我尝试过使用grep
(崩溃)和其他人
我确信必须有一个非常简单的答案,我无法看到!
答案 0 :(得分:2)
使用grep -f
grep -f FileB FileA
答案 1 :(得分:0)
以下是awk
awk 'FNR==NR {a[$0];next} {for (i in a) if (i~$1) print i}' FileA FileB
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ
或者像这样:
awk 'FNR==NR {a[$0];next} ($NF in a)' FileB FileA
chr2 200000 200033 X GeneY
chr3 300000 300055 G A GeneZ