重塑R中的数据框:行到列

时间:2015-01-19 13:55:53

标签: r algorithm optimization dataframe reshape

原始数据框中有3列:id,type和rank。现在我想创建一个新的数据框,将每个可能的类型值作为单个列(请参阅下面的小示例,原始数据包含> 100.000行和30种类型)

data1
id  type  rank
x   a     1
y   a     2
z   a     3
x   b     1
z   b     2
y   c     1     

data2
id  a  b  c
x   1  1  NA
y   2  NA  1
z   3  2  NA   

这就是我到目前为止所做的:

for (i in (1:nrow(data1))) {
  dtype <- data[i,2]
  if (any(data2$id == data1[i,1], na.rm = TRUE)) {
    row <- grep(data1[i,1],data2$id)
    data2[row,c(dtype)] <- data1[i,3]
  } else {
    data2[nrow(data2)+1,1] <- as.character(data1[i,1])
    data2[nrow(data2),c(dtype)] <- data1[i,3]
 }
}

这有效(我希望这个例子解释我在做什么),但它很慢。您是否有任何提示我如何优化此算法?

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

使用问题中提到的单词功能,您只需使用基础R中的reshape

> reshape(mydf, direction = "wide", idvar = "id", timevar = "type")
  id rank.a rank.b rank.c
1  x      1      1     NA
2  y      2     NA      1
3  z      3      2     NA

答案 1 :(得分:3)

以下是tidyr包中的示例。

library("tidyr")
library("dplyr")
data2<-
   data1 %>% spread(type, rank)

  id a  b  c
1  x 1  1 NA
2  y 2 NA  1
3  z 3  2 NA

答案 2 :(得分:3)

此处使用data.table

require(data.table)
ans = dcast.data.table(setDT(data1), id ~ type)
ans
#    id a  b  c
# 1:  x 1  1 NA
# 2:  y 2 NA  1
# 3:  z 3  2 NA