ImageJ:制作二进制图像时,如何确保相邻的单元格没有连接? (不是分水岭)

时间:2015-01-15 22:40:23

标签: imagej

我试图计算具有不规则形状的细胞。在使图像二进制之后,一些单元被连接并变成一个巨大的blob。结果,通过粒子分析,许多相邻的细胞被计为一个。在这种情况下, Watershed不起作用,因为单元格没有相似的形状,许多单个单元格被分成许多段。
到目前为止,我最好的尝试是在转动图像二进制之前最小化背景噪声。但还有另一种方式吗?

提前谢谢你,

KL

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您是否尝试过Trainable Weka Segmentation插件?它是Fiji distribution of ImageJ

的一部分

答案 1 :(得分:0)

另一个分割选项是Foci Picker 3D http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/foci-picker3d/index.html