cytoscape中的数字列

Question

我是cytoscape的新手。 我想根据一定数量在网络中制作边缘的宽度。

我的文件如下：

node1 node2 34.04
node3 node2 56.89
node4 node5 8.09
node1 node4 10.54

当我导入我的网络文件时，我选择第3列作为“交互”。然后第3列中的数字以字符串列结尾，不能用于进行连续映射。当我导入与节点属性相同的表时，我仍然只能将其输入到字符串列中。

我试图查看手册并搜索了很多 - 但我似乎是唯一一个遇到此问题的人。我该如何解决？ 感谢

Answer 1

这个答案适用于Cytoscape 2.8.3。它可能适用于3。？。？。

就像你说的，使用你的文件格式，数字将用于填充“交互”，这是一个String属性。

因此，对于您的文件，请不要在“从表格导入网络”对话框中设置“交互类型”（红色）。而是将Source Interaction（紫色）设置为Column 1，将Target Interaction（orange）设置为Column 2.然后，在对话框底部的表格中，单击列标题Column 3.它将变为蓝色。然后它将作为浮点属性导入为“列3”，您可以在连续映射器中使用它。