Colormap在NetworkX中不起作用

时间:2015-01-10 01:17:36

标签: python matplotlib graphviz networkx digraphs

我正在尝试制作彩色图表。我一直在遇到奇怪的行为。

我无法让色彩图自动为节点指定颜色。我尝试使用相同颜色的所有节点!

enter image description here

浮点数是应该分配给6个节点的颜色。 7个浮标中的两个是相同的,因为它是一个循环。

当我手动指定节点的颜色(node_color=['r']等)时,它工作正常,不仅对于根(红色),而且对于循环中的节点也是如此。

代码:

t=0
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.DiGraph()

#MAKE
G.add_node("ROOT")
#make all others
for i in x:
    for ct,j in enumerate(i):
        G.add_node(j[t] )
        if ct ==0:
            G.add_edge("ROOT", j[t])
        else:
            G.add_edge(i[ct-1][t], i[ct][t])
nx.write_dot(G,'g')
#DRAW
pos=nx.graphviz_layout(G,prog='neato')
nx.draw_networkx_nodes(G,pos, nodelist=['ROOT'], node_color=['r'])
#draw all others
for i in x:
    for ct,j in enumerate(i):
        print CD[j[t]]#, np.around([CD[j[t]]],decimals=2)
        nx.draw_networkx_nodes(G,pos, nodelist = [j[t]], cmap=plt.get_cmap('Set3') ,node_color=np.around([CD[j[t]]],decimals=2))#float(c) for c in nodecolors(x[i],1)] )
nx.draw_networkx_edges(G, pos,arrows=True)

#Display properties
limits=plt.axis('off')         

这里,x是节点名称数组,CD是将名称映射到浮点数的字典。为了完整起见,这里是:

x = [[(1.000004+0j)], [(-0.5000065+0.86602454j)], [(-0.5000065-0.86602454j)],[(1.000004+0j)],[(-0.5000065+0.86602454j)],[(-0.5000065-0.86602454j)]]

CD = {(-0.50000649677999998-0.8660245358880001j): 0.7142857142857143,
 (-0.50000649677999998+0.8660245358880001j): 0.5714285714285714,
 (-0.50000049676800007-0.86603492822400008j): 0.14285714285714285,
 (-0.50000049676800007+0.86603492822400008j): 0.42857142857142855,
 0j: 0.0,
 (0.99999200001600019-0j): 0.8571428571428571,
 (1.000004000004+0j): 0.2857142857142857}

在其他情况下,Colormap功能对我有用,所以我感觉我在犯一个基本错误。有任何想法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

由于这已经过时了,Lack在评论中回答了这个问题,我在这里复制他的答案并接受:

  

我无法正常运行您的代码(TypeError: 'complex' object has no attribute '__getitem__' on j[t])但问题与我回答的其他问题(stackoverflow.com/questions/27831022 / ...)相同。因为您一次只将一个节点传递给draw_networkx_nodes,所以"规范化"长度为1的颜色数组,与其他节点无关。你应该摆脱循环并将一个数组中的所有节点传递给draw_networkx_nodes