每次我使用自制软件升级R我都需要再次安装大多数软件包

Question

R软件包已安装到/usr/local/Cellar/r/3.1.2_1/R.framework/Versions/3.1/Resources/library

每当我运行brew upgrade r和R版本的更改时，我需要再次安装大多数库，因为安装路径会发生变化。

如何升级而无需重新安装所有内容？

编辑：我认为这回答了我的问题http://stackoverflow.com/questions/1401904/painless-way-to-install-a-new-version-of-r-on-windows

Answer 1

我将.libPaths("/Users/tim/.R/packages")放在我的~/.Rprofile中，以便将软件包安装到版本崩溃后不会消失的路径。

Answer 2

通过包含BioConductor和CRAN的包来扩展其他答案。

1. 安装前：备份当前包列表。

   tmp <- installed.packages() installedpkgs <- as.vector(tmp[is.na(tmp[,"Priority"]), 1]) save(installedpkgs, file="installed_old.rda")

2. 安装新版本的R

3. 从CRAN重新加载包

   load("installed_old.rda") tmp <- installed.packages() installedpkgs.new <- as.vector(tmp[is.na(tmp[,"Priority"]), 1]) missing <- setdiff(installedpkgs, installedpkgs.new) install.packages(missing) update.packages()

4. 从BioConductor重新加载包裹

   chooseBioCmirror() biocLite() load("installed_old.rda") tmp <- installed.packages() installedpkgs.new <- as.vector(tmp[is.na(tmp[,"Priority"]), 1]) missing <- setdiff(installedpkgs, installedpkgs.new) for (i in 1:length(missing)) biocLite(missing[i])

Answer 3

1. 将包列表另存为R数据文件

   tmp＆lt; - installed.packages（） installedpkgs＆lt; - as.vector（tmp [is.na（tmp [，“Priority”]），1]） save（installedpkgs，file =“installed_old.rda”）

2. 安装新版本

3. 加载列表，然后从CRAN下载旧包

   OAD（ “installed_old.rda”） tmp＆lt; - installed.packages（） installedpkgs.new＆lt; - as.vector（tmp [is.na（tmp [，“Priority”]），1]） 缺少＆lt; - setdiff（installedpkgs，installedpkgs.new） install.packages（失踪） update.packages（）