Question

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我运行MariaDB 5.5的本地实例，在那里我创建了一个有两个表的数据库。我必须使用存储在几千个.RData文件中的数据填充这些表。每个文件存储data.frames，其中包含几千到一百万行。

使用RMySQL和函数dbWriteTable似乎是最直接的解决方案。我使用RevolutionR的3.1.1版本（8.0 beta）。操作系统是Win7 x64。

MariaDB中的表格有两列：ID和VALUE，其名称为TAB。要存储的数据位于对象data.tab中。

我做什么

我按照以下步骤进行：

data.tab <- data.frame(ID = c(1:3), VAL = c(7:9))
db.con <- dbConnect(drv = MySQL(), user = "root", password = "myPasswrd", dbname="myDBname")
dbWriteTable(conn = db.con, name = "TAB", value = data.tab, append=TRUE, row.names=FALSE, field.types=character(ID="INT",VAL="FLOAT"))

或等效地，通过我创建的临时csv文件：

dbWriteTable(conn = db.con, name = "TAB", value = 'tmp.csv', append=TRUE, row.names=FALSE, field.types=character(ID="INT",VAL="INT"))

问题

调用上面代码段中的第二行会导致抛出以下错误：

Error in .local(conn, statement, ...) : 
sdbi114c7f07039' not found (Errcode: 22)tempRtmpE9YwdP

调用第三行（通过临时csv文件）会导致类似的错误，其中路径使用反斜杠打印出来。结果证明这与路径扩展有关。调试和打印statement会产生：

“LOAD DATA LOCAL INFILE”C：\\ TEMP \\ Rtemp \\ RtmpE9YwdP \\ rsdbi114c7f07039'INTO TABLE TAB由'\ n'终止的行（ID，VALUE ）;“

因此似乎反斜杠（\\）和\r的转义似乎是问题所在。不幸的是，我不知道如何处理这个问题。

追踪（在通话顺序中）：

1: dbWriteTable(conn = db.con, name = "t_ftr", value = fut.tbl, append = TRUE, row.names = FALSE,
2: .valueClassTest({standardGeneric("dbWriteTable")}, "logical", "dbWriteTable")
3: is(object, Cl)
4: is(object, Cl)
5: .local(conn, name, value, ...)
6: dbGetQuery(conn, sql)
7: dbGetQuery(conn, sql)
8: dbSendQuery(conn, statement, ...)
9: .valueClassTest(standardGeneric("dbSendQuery"), "DBIResult", "dbSendQuery")
10: is(object, Cl)
11: is(object, Cl)
12: .local(conn, statement, ...)
13: .Call(RS_MySQL_exec, conn@Id, as.character(statement))

修改

如果在statement中步骤11的交互式调试器中，我将\\替换为路径中的/，则数据将正确写入数据库。

Answer 1

似乎是RMySQL中的一个问题。我修复了这个问题，并在GitHub上提交了一个拉取请求：

https://github.com/rstats-db/RMySQL/issues/29

对我来说，它现在可以在我的电脑上使用。您可以编译并安装the development version from GitHub，或者等到CRAN上发布新版本的软件包。

编辑：它现在在CRAN上，版本0.10.1

RMySQL dbWriteTable在Windows 7 x64上遇到文件路径问题

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1 个答案: