Question

我有单行和多列的数据。我想在单个绘图中绘制每列的数据。我有100列像这样。什么是最好的方法在R中执行此操作。

matplot(df[1,],type="o")

我已尝试过以下各种选项，以下数据：

  gene  Sample_23770_A54T_RNAX  Sample_27931_RNAX   Sample_28891_RNAX   Sample_28897_RNAX Sample_28977_RNAX Sample_28979_RNAX   Sample_PM100_Z1_1_RNA   Sample_PM117_Z10_1_Case_RNASeq Sample_PM117_Z1_1_Case_RNASeq
  CD274 5.9315  1.9569  10.3786 5.2705  5.7112  1.814   0.3493  0.6846  1.0373

另外，我可以对多列使用ggplot函数吗？基本上，我想绘制单行的表达式值，比较100个不同的列。

Answer 1

使用ggplot2：

library(ggplot2)
cd274 <- read.table(text = "gene  Sample_23770_A54T_RNAX  Sample_27931_RNAX   Sample_28891_RNAX   Sample_28897_RNAX Sample_28977_RNAX Sample_28979_RNAX   Sample_PM100_Z1_1_RNA   Sample_PM117_Z10_1_Case_RNASeq Sample_PM117_Z1_1_Case_RNASeq
CD274 5.9315  1.9569  10.3786 5.2705  5.7112  1.814   0.3493  0.6846  1.0373", header = T)
cd274 <- melt(cd274[, 2:ncol(cd274)])
ggplot(cd274, aes(x = variable, y = value)) + geom_bar(stat = "identity") + coord_flip()

从多列绘制值，但是对于一行

1 个答案: