Question

 sample
      Symobls  IDs Value1 Value2 Value3
 1     NA      NA   3.1    2.3    1.7
 2     TP53   1234  5.8    6.9    10.1
 3     Kras   5678  0.1    0.3    0.5
 4     NA      NA   10.3   2.1    7.9
 5     Hras   9991  20.0   30.0   40.0
 6     TP53   1234  -3.1   0.2    1.7

我的表看起来像这个。我需要按行或列来计算值。所以，我尝试使用符号作为新的行名。通过这种方式，我可以使用样本[，＆＃34; Hras＆＃34;]来计算整行值。当试图这样做时，我遇到了这个问题。

rownames（样品）LT; -sample [1]

row.names<-.data.frame（*tmp*，值=值）出错：     重复＆＃39; row.names＆＃39;不允许   另外：警告信息：   设置＆＃39; row.names＆＃39;：'A1CF'，'A2M'，'A2ML1'，'AAGAB'，'AAK1'，'AAMDC'，'AARS2'，'AASDH'，'时的非唯一值AASDHPPT'，'AASS'，'ABAT'，'ABCA1'，'ABCA13'，'ABCA2'，'ABCA4'，'ABCA5'，'ABCA8'，'ABCA9'，'ABCB1'，'ABCB11'，'ABCB4' ，'ABCB5'，'ABCB6'，'ABCB8'，'ABCB9'，'ABCC1'，'ABCC10'，'ABCC11'，'ABCC12'，'ABCC13'，'ABCC3'，'ABCC4'，'ABCC5'，' ABCC6'，'ABCC8'，'ABCC9'，'ABCD3'，'ABCD4'，'ABCE1'，'ABCF2'，'ABCG1'，'ABHD1'，'ABHD10'，'ABHD11'，'ABHD12'，'ABHD13' ，'ABHD17B'，'ABHD2'，'ABHD5'，'ABHD6'，'ABI1'，'ABI2'，'ABI3BP'，'ABL2'，'ABLIM1'，'ABLIM2'，'ABO'，'ABR'，' ABRA'，'ABTB1'，'ABTB2'，'ACAA1'，'ACAA2'，'ACACA'，'ACACB'，'ACAD10'，'ACADL'，'ACADSB'，'ACAN'，'ACAP1'，'ACAP2' ，'ACAP3'，'ACAT 1'，��[...截断]

这是因为＆＃34; NA＆＃34;？其他选择？感谢

这是一个微阵列数据集。我已经完成了标准化，并提取了几个基因的值来进行绘图，互相关和t检验。事实上，不仅NA而且我将用于绘制图形的几个基因都有多行。所以，我需要将它们提取到另一个表中供以后使用。

Answer 1

在这里，我只是回答了一个方法，可以根据您在问题中的要求更改row.names。最终目标尚不清楚。对于指定的问题，您可以尝试将make.names与选项unique=TRUE一起使用。这将确保重复项的命名方式不同。在第一列中，有NA个值，这些值将被命名为NA.，NA..1等。（如果可以的话）。

 row.names(sample) <- make.names(sample[,1],TRUE)

或者@Richard Scriven评论，

row.names(sample) <- paste(make.unique(df[,1]))

另一种选择是将data.frame转换为matrix（这将允许重复值）。只有当columns属于同一类时，我才会推荐这个。例如，如果您有character和numeric列，则会将所有列转换为character类。在您的数据集中，在我看来除了第一列之外，所有其他都是数字（可能除了“ID”列）。但是NA值再次成为问题。如果你想根据rownames对'1st'或'3rd'行进行子集化，那将很困难。

sample1 <- as.matrix(sample[,-1])
row.names(sample1) <- sample[,1]
sample1['Hras',]
#  IDs Value1 Value2 Value3 
#  9991     20     30     40

将第一列设置为rowname，尽管有重复

1 个答案: