Cytoscape.js对XGMML或其他稳定格式有什么支持?

时间:2015-01-02 16:58:34

标签: cytoscape.js

我看到Cytoscape.js具有Cytoscape Web的许多强大功能。但我没有在Cytoscape.js中看到XGMML支持。那是对的吗?是否在路线图上支持XGMML图形,或者是否有一些简单的方法将XGMML文件转换为Cytoscape.js可以读取XGMML的格式?

有关稳定文档格式的计划有哪些计划?

由于 泰德

Ted Goldstein,博士 加州大学圣克鲁兹基因组学研究所

1 个答案:

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xmojmr指出这不是一个具体的代码帮助问题。

无论如何 - 在我看来,像这样的格式不应该在Cytoscape.js项目的范围内。 Cytoscape.js是JS的图形库,文件解析应该是一个单独的库。这样的库甚至不需要支持特定的Cytoscape.js JSON"格式",因为将一个对象数组(由解析得到)映射到Cytoscape预期的层次结构非常简单的.js。

在我看来,XGMML格式本身并不是很好,并且这是另一次反对包含它的攻击。但是,许多人确实拥有该格式的遗留数据,因此您可能会发现一个通用的JS XML解析库很有用。如果您只需要来自XGMML的图形数据,那么使用JS XML解析库应该可以非常简单地映射到您喜欢的任何JSON格式。