分位数和在R中的动物园对象上聚合

时间:2014-12-17 16:39:08

标签: r aggregate quantile

我的zoo对象看起来像

library(zoo)
library(lubridate)
TimeStamp=seq(dmy("01/01/2002"), dmy("17/12/2014"), by="day")
Dummy= rnorm(length(TimeStamp))
Temp=zoo(Dummy,TimeStamp)

我试图计算一年中每天的5%,33%,67%和95%百分位数/分位数,以创建“标准”。 因此,对于01/01,我希望根据我在数据集中1月1日的所有观察得到4个分位数值。每天都一样。

现在我正在使用它:

aggregate(Temp ~ day(index(Temp)) + month(index(Temp)), FUN = 'quantile')

问题是使用此函数我不确定返回quantile函数的值是什么。

有什么建议吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您需要学习如何阅读帮助页面(有时您需要了解@GGrothendeick刚刚指出的帮助页面)。我可能(确实)认为第一页可行,但我错了:

 ?aggregate.zoo     # 
 ?aggregate.formula # fortunately, they are the same w.r.t the dots-arg

帮助页面有一个用法部分:

## S3 method for class 'zoo'
aggregate(x, by, FUN = sum, ..., regular = NULL, frequency = NULL)
## S3 method for class 'formula'
aggregate(formula, data, FUN, ...,
          subset, na.action = na.omit)

这样...,将任何参数传递给quantile函数。 (从页面上看不清楚是否可以接受字符名称,但如果你没有收到错误,那么你已经测试过了。分位数功能:

  ?quantile

...有一个用法部分:

## Default S3 method:
quantile(x, probs = seq(0, 1, 0.25), na.rm = FALSE,
         names = TRUE, type = 7, ...)

因此,您需要提供符合您所需级别的'probs'参数,因为此时您获得的默认级别为:min,25th百分位数,中位数,75th百分位数和最大值。所以试试:

aggregate(Temp ~ day(index(Temp)) + month(index(Temp)), 
          FUN = 'quantile', probs=c(5, 33, 67, 95)/100 )

回想起来,你所提供的公式会成功,这似乎是一个编程奇迹:我想我们会按照aggregate的'zoo'帮助页面中的示例来使用它:

 str( aggregate(Temp,  time(Dummy), 
            FUN = 'quantile', probs=c(5, 33, 67, 95)/100 ) )

‘zoo’ series from 1 to 4734
  Data: num [1:4734, 1:4] 0.235 -1.435 -0.922 -0.542 -1.151 ...
 - attr(*, "dimnames")=List of 2
  ..$ : NULL
  ..$ : chr [1:4] "5%" "33%" "67%" "95%"
  Index:  num [1:4734] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...