lme4模型功能概述(lmerTest)

时间:2014-12-17 14:49:18

标签: r summary lme4

如果有以下数据

d = data.frame(out=rnorm(10), explain=rnorm(10), age=rnorm(10), sex=sample(c("M", "F"), size=10, replace=T), group=rep(c(1:5), 2))
f = as.formula("out ~ explain + age + sex + (1|group)")

并希望使用lme4拟合线性模型

require(lme4)
require(lmerTest)
m  = lmer(f, d)
s  = summary(m)

这很好用......但是如果模型适合像

这样的另一个函数
gglm = function(form, data){
    lm = lmer(form, data=data)
    return(lm)
}
m2 = gglm(f, d)
s2 = summary(m2)

我收到错误。

summary from lme4 is returned
some computational error has occurred in lmerTest

显然,这是因为模型的拟合是使用名为data的对象完成的,该对象在外部范围内不可见。所以,如果我data = d,我会得到与以前相同的结果。但是,如果我这样做

data = data.frame(out=rnorm(10), explain=rnorm(10), age=rnorm(10), sex=sample(c("M", "F"), size=10, replace=T), group=rep(c(1:5), 2))

而是获取不同的数据,摘要的结果是错误的。

这似乎不是最好的方法,我认为很容易犯错误。正常lm及其summary函数不存在此问题。是不是有办法让lmerTest摘要不易出错?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

do.call技巧有效(但肯定是一种解决方法)。

gglm = function(form, data){
  lm = do.call(lmer, list(formula=form, data=data))
  return(lm)
}
m2 = gglm(f, d)
s2 = summary(m2)