将先前生成的r对象导入Rmarkdown

Question

我希望这个问题在这里有意义和适当：

本质上，我在Rmd文件中编写代码，该文件包含一个非常长的循环数据随机化模拟。这个过程需要相当长的时间才能完成（> 2分钟 - 它是一个很大的模拟）。我存储结果，然后使用这些结果在整个Rmd报告中以各种方式进行分析和可视化。

但是，在创建和编辑报告时，我可能希望看到我的代码和文本编辑如何改变html输出。每次执行knitr：html命令时，我都要经历另外2分钟的数据随机化。这显然会令人沮丧地缓慢。

有没有办法在Rmd文件之外执行for循环过程，存储结果，然后将这些结果导入Rmd文件。我很确定Rmd无法从全局环境导入。我想知道是否有人知道这样做的方法？

Answer 1

使用saveRDS将模拟结果保存到rds文件。然后在readRDS文件的顶部添加对Rmd的调用。您可能希望在echo = FALSE的块中执行此操作。

Answer 2

您要做的是缓存从每个“块”生成的结果

请参阅菜单。

http://yihui.name/knitr/demo/cache/

我希望你使用RStudio，缓存更容易

可替换地，

使用带有R的IPython进行结账。https://www.google.com.au/webhp?sourceid=chrome-instant&ion=1&espv=2&ie=UTF-8#q=using%20Ipython%20with%20R 默认情况下，IPython中每个单元格中生成的所有数据（不论R / Python）都将缓存在每个单元格中，并可在单元格之间共享。