我使用R中的data.table包来读取大型数据帧(65046行,101959列)。 fread正在为我的小数据帧工作。当我尝试读取感兴趣的数据帧时,我收到以下错误:
dat <- fread("input_file")
Error: segfault from C stack overflow
R会话信息如下:
R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US
[4] LC_COLLATE=en_US LC_MONETARY=en_US LC_MESSAGES=en_US
[7] LC_PAPER=en_US LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
[10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] data.table_1.9.4
loaded via a namespace (and not attached):
[1] chron_2.3-45 plyr_1.8.1 Rcpp_0.11.3 reshape2_1.4 stringr_0.6.2
我发现了这个question reporting a similar bug with version 1.8.9,但我正在运行1.9.4版,所以我不确定如何解决这个问题。