使用data.table从R堆栈中溢出C段溢出

时间:2014-12-01 19:25:31

标签: r data.table

我使用R中的data.table包来读取大型数据帧(65046行,101959列)。 fread正在为我的小数据帧工作。当我尝试读取感兴趣的数据帧时,我收到以下错误:

dat <- fread("input_file")
Error: segfault from C stack overflow

R会话信息如下:

R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US       LC_NUMERIC=C         LC_TIME=en_US       
 [4] LC_COLLATE=en_US     LC_MONETARY=en_US    LC_MESSAGES=en_US   
 [7] LC_PAPER=en_US       LC_NAME=C            LC_ADDRESS=C        
[10] LC_TELEPHONE=C       LC_MEASUREMENT=en_US LC_IDENTIFICATION=C 

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] data.table_1.9.4

loaded via a namespace (and not attached):
[1] chron_2.3-45  plyr_1.8.1    Rcpp_0.11.3   reshape2_1.4  stringr_0.6.2

我发现了这个question reporting a similar bug with version 1.8.9,但我正在运行1.9.4版,所以我不确定如何解决这个问题。

0 个答案:

没有答案