为R＆lt; glmnet正确格式化数据的问题

Question

我正在尝试使用glmnet来拟合泊松模型，但我似乎无法以正确的形式获得正确的数据。所有变量都是分类的。这是一个早期的问题，处理几乎相同的问题，但给出的解决方案没有帮助我 - as.matrix()和model.matrix只是抛出了更多的错误信息。

as.matrix这里是我得到的：

x<-as.matrix(ld2)

> res<-glmnet(x,y,family = "poisson")
Error in fishnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs,  : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 4)

In addition: Warning message:
In fishnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs,  :
  NAs introduced by coercion

有什么想法吗？

Answer 1

你应该试试

x <- model.matrix(~.,data=ld2)

model.matrix()是用于将数据框（包含数字和分类预测变量）转换为数值模型矩阵的R函数;分类预测变量变为二元虚拟预测变量集。公式~.，特别是点，表示“使用数据框中的所有变量作为主要效果”（这是一个片面的公式 - 无需在左侧指定响应变量 - ~）的一面。