尝试对krig值进行成像时出错

时间:2014-11-25 21:16:39

标签: r heatmap raster kriging geor

尝试从

的Krig苯值
    WELL.ID   X           Y     BENZENE
1   MW-02   268.8155    282.83  0.00150
2   IW-06   271.6961    377.01  0.00050
3   IW-07   251.0236    300.41  0.01040
4   IW-08   278.9238    300.37  0.03190
5   MW-10   281.4008    414.15  2.04000
6   MW-12   391.3973    449.40  0.01350
7   MW-13   309.5307    335.55  0.01940
8   MW-15   372.8967    370.04  0.01620
9   MW-17   250.0000    428.04  0.01900
10  MW-24   424.4025    295.69  0.00780
11  MW-28   419.3205    250.00  0.00100
12  MW-29   352.9197    277.27  0.00031
13  MW-31   309.3174    370.92  0.17900

我生成一个网格(这些井所在的属性),如此

setwd("C:/.....")
getwd()

require(geoR)
require(ggplot2)


a <- read.table("krigbenz_loc.csv", sep = ",", header = TRUE)
b <- data.matrix(a)
c <- as.geodata(b, coords.col = 2:3, data.col = 4, )

ggplot(a, aes(x= X, y= Y, colour="green", label=WELL.ID)) + geom_point() + geom_text(aes(label=WELL.ID),hjust=0, vjust=0)

x.range <- as.integer(range(a[,2]))
y.range <- as.integer(range(a[,3]))
x = seq(from=x.range[1], to=x.range[2], by=1)
y = seq(from=y.range[1], to=y.range[2], by=1)
length(x)
length(y)
xv <- rep(x,length(y))
yv <- rep(y, each=length(x))
in_mat <- as.matrix(cbind(xv, yv))

查看变异函数..(不是很漂亮,但正在研究它)

### variogram ###

## on geo-object
v1 <- variog(c)
length(v1$n)
v1.summary <- cbind(c(1:11), v1$v, v1$n)
colnames(v1.summary) <- c("lag", "semi-variance", "# of pairs")
v1.summary
plot(v1, type = "b", main = "Variogram: BENZENE at CRAIG BP")

使用ksline生成krig值...

## variance of benzene readings = sd^2

sd <- sd(a$BENZENE)
var = sd^2

fitted_model <- variofit(vario=v1, ini.cov.pars=c(var, .29), cov.model='exp')
q <- ksline(c, cov.model=fitted_model$cov.model, cov.pars=fitted_model$cov.pars,
        nugget=fitted_model$nugget, locations=in_mat)

但是当我尝试对结果进行成像时,它会保留手机,错误!!!!

> image(q, val = q$predict)
Error in eval(x$call$geodata, envir = attr(x, "parent.env"))$borders :
   object of type 'builtin' is not subsettable

这似乎是完全脱离了左边的字段,因为我已经过了好几次...我搜索了错误,似乎我试图调用一个函数的子集,答案90%的时间是我的语法错误,但我检查了一切,我无法弄明白...任何帮助将不胜感激。

感谢

ZR

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

这看起来像是geoR中糟糕的评估情况。我的意思是,一个错误!

如果您将c对象重命名为其他对象,则可以:

ccc =c 
q <- ksline(ccc, cov.model=fitted_model$cov.model, cov.pars=fitted_model$cov.pars,
        nugget=fitted_model$nugget, locations=in_mat)
image(q) # now works

这是因为image.kriging正试图从原始c对象中获取某些东西,但它没有在正确的上下文中对其进行评估,因此它获得了R base c函数(错误中的“内置”一词是我的线索。

ksline帮助也说

  

除非移动,否则应优先使用'krige.conv'功能   邻居将被使用。

所以也许你应该尝试一下 - 它可能没有同样的问题!请注意,它有一组不同的ksline参数。