GeoR ksline中Krig的协方差参数

时间:2014-11-24 22:18:23

标签: r gis covariance kriging geor

我有一个小的数据集位置和苯浓度,单位为mg / kg

    WELL.ID   X           Y     BENZENE
1   MW-02   268.8155    282.83  0.00150
2   IW-06   271.6961    377.01  0.00050
3   IW-07   251.0236    300.41  0.01040
4   IW-08   278.9238    300.37  0.03190
5   MW-10   281.4008    414.15  2.04000
6   MW-12   391.3973    449.40  0.01350
7   MW-13   309.5307    335.55  0.01940
8   MW-15   372.8967    370.04  0.01620
9   MW-17   250.0000    428.04  0.01900
10  MW-24   424.4025    295.69  0.00780
11  MW-28   419.3205    250.00  0.00100
12  MW-29   352.9197    277.27  0.00031
13  MW-31   309.3174    370.92  0.17900

我正在尝试将网格中的值(这些井所在的属性)克服(如此

setwd("C:/.....")
getwd()

require(geoR)
require(ggplot2)


a <- read.table("krigbenz_loc.csv", sep = ",", header = TRUE)
b <- data.matrix(a)
c <- as.geodata(b)

x.range <- as.integer(range(a[,2]))
y.range <- as.integer(range(a[,3]))
x = seq(from=x.range[1], to=x.range[2], by=1)
y = seq(from=y.range[1], to=y.range[2], by=1)
length(x)
length(y)
xv <- rep(x,length(y))
yv <- rep(y, each=length(x))
in_mat <- as.matrix(cbind(xv, yv))

这是我用

开始Krig的时候
q <- ksline(c, cov.model="exp", cov.pars=c(10,3.33), nugget=0, locations=in_mat)

然而,当用

查看输出时
cbind(q$predict[1:10], q$krige.var[1:10])

我看到了

         [,1]     [,2]
 [1,] 343.8958 10.91698
 [2,] 343.8958 10.91698
 [3,] 343.8958 10.91698
 [4,] 343.8958 10.91698
 [5,] 343.8958 10.91698
 [6,] 343.8958 10.91698
 [7,] 343.8958 10.91698
 [8,] 343.8958 10.91698
 [9,] 343.8958 10.91698
[10,] 343.8958 10.91698

这些值不会因前5000行而改变...(因为max.print = 5000而无法查看更多...不知道如何改变它,但这是一个正切...)

我意识到我的

cov.pars = c(10,3.33)

范围和基石,可能是问题。

geoR.pdf,第19页描述了cov.pars的预期,但我不确定如何决定这些协方差参数需要做什么。

是否有方法可以从现有数据中找到合适的值,还是可以将这些值设置为通用值,其输出类似于在ESRI ArcGIS的空间分析包中执行的克里金法?

ZR

:::: EDIT :::

我的地理数据对象未正确转换... 这是正确的方法

c <- as.geodata(b, coords.col = 2:3, data.col = 4, )

也...对于变差函数,

v1 <- variog(c)
length(v1$n)
v1.summary <- cbind(c(1:11), v1$v, v1$n)
colnames(v1.summary) <- c("lag", "semi-variance", "# of pairs")
v1.summary

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

执行此操作的一种方法是使用variofit函数(也在geoR包中)来估计协方差参数。例如,使用您的数据和初始值:

vario <- variog(c)  # See other options here for binning, etc
# Note that the order of the cov.pars is variance, then range, (see your question)
fitted_model <- variofit(vario=vario, ini.cov.pars=c(10, 3.33), cov.model='exp')
q <- ksline(c, cov.model=fitted_model$cov.model, cov.pars=fitted_model$cov.pars,
            nugget=fitted_model$nugget, locations=in_mat)

顺便说一下,值得花时间看一下变异函数。