使用ggplot包在R中制作图表

Question

我试图在x轴上并排显示5个基因（SHP ...... PHB）的qRT-PCR值的条形图（使用ggplot），比较y轴上的归一化倍数诱导（例如，大多数诱导基因是SHP，归一化倍数诱导~30，然后是NGA1等。 我已经挣扎了很多，不能在R中形成这个数字。有谁能请帮我一个忙吗？非常感谢。

Rep | SHP | NGA1 | PAN | TUB | PHB

Rep1 | 29.77 | 4.55 | 3.23 | 1.28 | 0.06 |

Rep2 | 30.37 | 3.43 | 2.07 | 0.81 | 4.93

Answer 1

嗯，我认为这就是你想要的：

library(ggplot2) #load library

genes<-factor(c('SHP', 'NGA1', 'PAN', 'TUB', 'PHB')) 
values1<-c(29.77,4.55,3.23,1.28,0.06)
values2<-c(30.37,3.43,2.07,0.81,4.93)
df<- data.frame(genes,values1,values2)  #put your data in dataframe

ggplot(data=df,aes(x=genes,y=values1)) + geom_bar(stat='identity') +  #plot with ggplot2
  scale_x_discrete(limits=df$genes[order(levels(df$genes))])          #order your data descending

我绘制了名称在x轴上，值为1在y轴上的数据。如果需要，可以使用上面的代码作为值。