在构建我的R包之前，我已在笔记本电脑上安装了Rtools v.31和MKTeX2.9。运行R CMD检查后，出现了一个名为mypackage.Rcheck的目录和源文件mypackage_1.x.tar.gz，虽然RStudio构建包函数正在检查所有内容，但没有警告或错误消息，但最后是说（如下），应该包含PDF手册的相应mypackage.Rcheck目录消失了：
R CMD检查成功
我认为这可能是Rtools和R之间的版本冲突，因为我正在使用R13.1.2和Rtools v.31，在http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/网站上，它说图像没有被冻结（我不明白它意味着什么）。但我尝试了Rtools和R之间所有建议的兼容版本对，但仍然无法使其正常工作。所以我认为mypackage.RCheck的消失不是因为版本冲突。
我不认为这是MiKTeX问题，因为显然生成了pdf，但因此被删除了。我也尝试在R CMD检查中使用--options，但是没有办法强制生成pdf手册，加上pdf是在一个点生成的。我还阅读了本网站上的一篇文章，建议使用Rutils函数Rd2pdf：“R CMD Rd2pdf mypackage”，但我无法在Windows上运行，并且Rutils软件包不适用于R13.1.2。
有人可以提出问题的根源，或者他们之前是否已经看过这个问题，并且能够修复它吗？
答案 0 :(得分：22)
在RStudio中：工具 - ＆gt;全球选项 - ＆gt;包。成功进行R CMD检查后，有一个设置＆＃34;清理输出＆＃34;。如果选中此选项，则会在成功检查后删除package.Rcheck文件夹。如果取消选中此设置，则不会删除package.Rcheck文件夹，您可以在那里找到参考手册pdf。
答案 1 :(得分：1)
来自R tarball的文件神秘消失的一个常见问题是意外地指定它们应该在.Rbuildignore文件中被忽略。该文件中的行是正则表达式，因此不使用锚点^和$可以使它们匹配比您预期的文件更多的文件。例如，
vig.e
匹配vignette.pdf（因为名称的开头和结尾没有锚点，而且 dot表示＆＃34;任何字符＆＃34;。