所以我使用Linux VM，我在那里有几个repos，我在VM上运行代码。我在VM上设置了Samba共享，因此我可以从Windows计算机访问存储库并在Windows中编辑它们。我有这个设置的原因有很多，但这超出了这个问题的范围。
编辑体验相当不错，但还有一件事令人烦恼：我在Windows上使用Atom来编辑我的文件，它非常适合在内部使用git diff处理文件中的更改。然而，当它们没有时，它将许多文件着色为已经改变。
要进行故障排除，我在Windows框中打开了一个命令行并在repo上运行git status，当repo中实际上没有未提交的更改时，它错误地显示了大量文件已更改。我在Linux机器上执行所有git操作，但至少具有一致的状态会很好。
在Linux或Windows端是否有某种git配置可用于使两者更兼容？
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好的，在挖掘了一些之后，我发现问题是由于我的Samba配置导致的不同文件模式标志。我能够通过在repo级别禁用fileMode选项来解决问题：
git config --unset core.fileMode
并在Windows框中全局设置：
git config --global core.fileMode true