在Windows XP上的R中进行多核处理 - 通过doMC和foreach

时间:2010-04-23 05:08:45

标签: windows r parallel-processing multicore

我发布此问题是为了询问有关如何在Windows XP计算机上优化R中多个处理器的使用的建议。

目前我正在创建4个脚本(例如for(i in 1:100)和(i in 101:200)等),我同时在4个不同的R会话中运行。这似乎使用了所有可用的cpu。

但是我希望这样做更有效率。一种解决方案可能是使用“doMC”和“foreach”软件包,但这在Windows机器上的R中是不可能的。

e.g。

library("foreach")
library("strucchange")
library("doMC") # would this be possible on a windows machine?
registerDoMC(2)  # for a computer with two cores (processors)
## Nile data with one breakpoint: the annual flows drop in 1898
## because the first Ashwan dam was built
data("Nile")
plot(Nile)

## F statistics indicate one breakpoint
fs.nile <- Fstats(Nile ~ 1)
plot(fs.nile)
breakpoints(fs.nile)     # , hpc = "foreach" --> It would be great to test this.
lines(breakpoints(fs.nile))

任何解决方案或建议?

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

尝试doSNOW并行后端 - Windows上开箱即用。与雪插座群集一起使用。

答案 1 :(得分:4)

为了完整起见,这里是Tal的评论所要求的答案,它提供了一个简单而便携的替代方案。答案包括运行

 > library(snow)
 > help(makeCluster)

并运行示例顶部的前三行代码:部分:

> cl <- makeCluster(c("localhost","localhost"), type = "SOCK")
> clusterApply(cl, 1:2, get("+"), 3)
[[1]]
[1] 4

[[2]]
[1] 5

> stopCluster(cl)
> .Platform$OS.type
[1] "windows"
> 

真的那么难吗?

doSNOW等附加软件包 foreach可以通过便携方式使用此功能。

答案 2 :(得分:3)

您可以从REvolution Computing尝试doSMP。 有关详细信息,请参阅此博文: Parallel Multicore Processing with R (on Windows)