Question

我有一台输出jcamp-dx（* .jdx）文件的工具。我可以使用软件来查看数据，但我宁愿用它做一些其他事情，比如在网页上绘制它，我不得不访问数据中的软件。

数据文件是纯文本，但它们有一些奇怪的格式我还没有解密。完整的数据文件here:

第一部分显然是标题，注意仪器设置。数据集摘录：

##DATA TABLE=       (X++(R..R)), XYDATA     $$ real data
0B11342B85545C23989C17351B74931B05470A26105D9294a1056e3313g0949f8969e3550c7777
0.003500000108b6949b6475c8140f4800i9368a29728a55860a65707a61314a41319a07814
0.006250000093f4324a7318C0833G6565A17668A50784A82638B02193B14577B15248A98749
0.008999999613A67352A16985D8866c0263a07145a73892b26727b51285b50303b20050a63440
...

有人可能认为数据表会是某种csv，遗憾的是我没有看到这一点。下一个像其他行一样，所以假设它是一个校验和或一些编码的字符串。其他3行（以及之后的其他类似行）似乎有一个模式，遗憾的是我不知道如何将它们解码成有意义的数据。我确定如果有足够的时间我可以弄明白，但我希望有更多技术人员可以向我指出结构。

0.008999999613, A67352, A16985, D8866, c0263, a07145, a73892, b26727, b51285, b50303, b20050, a63440,

我可以看到每个字母后面有5位数字。不知道这些字母是什么意思，它们似乎有所不同。也许Capital A是正数而小写a是负数。 X ++会成为什么样的反击者？

X，Y，我认为这是有道理的。那么真实的数据？什么像强度？然后它下来一个页面，数据表变为：

##DATA TABLE=       (X++(I..I)), XYDATA     $$ imaginary data

我可以看到数据表的长度也是197个字符串。但我仍然只是猜测数据的实际含义及其格式。

有人可以帮助我吗？这里有化学家吗？想法？给我一些困惑的是每组数字之间字母的变化。

是的，我看到http://www.jcamp-dx.org/ 但我没有看到任何讨论数据格式的地方。

是否有任何开源工具可以将jdx转换为csv？我只是想找点东西来帮助我格式化。请协助。

Answer 1

看起来格式是在该网站的“标准”导航链接链接的PDF中描述的。

http://www.jcamp-dx.org/protocols.html

Answer 2

以下是我发现的关于JCAMP-DX的内容。它是纯文本数据文件。我有一个.jdx文件，它是在红外波段测量的CO2吸收光谱。可以在Gnumeric电子表格中轻松打开.jdx文件。编辑文件后，可以在Gnuplot中轻松打开.jdx文件，将＃放在任何没有初始＃的注释行的前面。

令我高兴的是，在没有阅读评论的情况下，二氧化碳吸收光谱文件以我想要的x和y单位打开。

Ubuntu Linux上的Gnuplot 4.6。 gnuplot的＆GT;情节＆＃39; co2.jdx＆＃39; ;宾果！

Answer 3

尽管这个问题是几年前发布的，但我还是偶然发现了一个可能的解决方案，尽管它需要专有软件。

结果是，MATLAB（对我来说是R2017a）具有built-in ability来打开这些数据。

您可以运行

JCAMPStruct = jcampread(File)

其中file是指“指定文件名，路径和文件名或指向文件的URL的字符向量”。（我在这里引用链接的帮助）。这对我超级有用，因为然后我可以分别通过访问JCAMPStruct.Blocks.Xdata和...Ydata来提取X（波数）和Y（透射率）。

对于有权使用MATLAB的任何人（如果您在学术界工作，您的研究所可能已获得许可...），这应该是一个简单的解决方法。

什么是JCAMP-DX数据格式？

3 个答案: